200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3071 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  666    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  81.73 
 
 
359 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  79.69 
 
 
358 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  78.93 
 
 
368 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  75.62 
 
 
367 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  73.98 
 
 
368 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  69.97 
 
 
372 aa  458  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  68.49 
 
 
348 aa  454  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  68.12 
 
 
362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  62.81 
 
 
365 aa  403  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  59.71 
 
 
378 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  59.12 
 
 
378 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  58.82 
 
 
378 aa  391  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  62.42 
 
 
359 aa  370  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  55.94 
 
 
346 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  57.14 
 
 
333 aa  363  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  55.76 
 
 
320 aa  360  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  55.7 
 
 
330 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  62.22 
 
 
327 aa  355  7.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  53.46 
 
 
318 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  52.6 
 
 
346 aa  341  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  51.08 
 
 
347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  48.48 
 
 
364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  50.16 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  48.89 
 
 
318 aa  294  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  49.68 
 
 
354 aa  286  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  48.56 
 
 
356 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  48.56 
 
 
336 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  46.33 
 
 
351 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  48.88 
 
 
342 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  47.13 
 
 
345 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  46.18 
 
 
342 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  47.17 
 
 
337 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  47.6 
 
 
355 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  46.84 
 
 
355 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  46.5 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  46.18 
 
 
321 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  45.28 
 
 
342 aa  269  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  46.56 
 
 
305 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  46.35 
 
 
342 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  45.54 
 
 
355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  48.41 
 
 
347 aa  260  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  45.05 
 
 
360 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  44.41 
 
 
360 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  37.1 
 
 
302 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  37.09 
 
 
303 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  35.74 
 
 
301 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  35.56 
 
 
305 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  35.87 
 
 
305 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  34.62 
 
 
306 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  34.62 
 
 
306 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  34.62 
 
 
306 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  33.97 
 
 
305 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  34.29 
 
 
310 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  34.29 
 
 
310 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  35.13 
 
 
312 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  34.29 
 
 
306 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  34.29 
 
 
306 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 
306 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  34.29 
 
 
306 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  34.84 
 
 
304 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  34.29 
 
 
305 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  36.64 
 
 
304 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  34.63 
 
 
307 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  36.61 
 
 
305 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  36.82 
 
 
352 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  36.3 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  36.56 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  34.25 
 
 
363 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  34.25 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  34.25 
 
 
363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  34.22 
 
 
306 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  33.55 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  40.1 
 
 
237 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  35.52 
 
 
351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  40.12 
 
 
237 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  34.89 
 
 
367 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  34.54 
 
 
377 aa  132  9e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.84 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  35.78 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  31.63 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  32.05 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  31.82 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  33.11 
 
 
310 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  35.55 
 
 
326 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  33.02 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  33.02 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  31.49 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  30.03 
 
 
451 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  29.21 
 
 
311 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  32.69 
 
 
308 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  42.98 
 
 
340 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  29.19 
 
 
298 aa  95.9  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  30.94 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  29.7 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  30.18 
 
 
299 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  30.21 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  45 
 
 
132 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  38.97 
 
 
319 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  28.29 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>