264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6460 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  100 
 
 
308 aa  614  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  46.02 
 
 
305 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  42.37 
 
 
295 aa  242  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  43.33 
 
 
316 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  44.71 
 
 
315 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  44.37 
 
 
295 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  43 
 
 
306 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  44.37 
 
 
295 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  42.32 
 
 
306 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  48.32 
 
 
312 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  43.64 
 
 
314 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  42.96 
 
 
315 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  40.75 
 
 
296 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  38.67 
 
 
296 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  37.46 
 
 
318 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
297 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
313 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
313 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
313 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  38.03 
 
 
313 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
302 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  30.79 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  36.04 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  36.13 
 
 
317 aa  142  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  34.47 
 
 
311 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
295 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  32.88 
 
 
292 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
295 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  28.66 
 
 
309 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  32.97 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  32.73 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  32.55 
 
 
298 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  29.39 
 
 
304 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  32.98 
 
 
301 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  32.33 
 
 
307 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  39.86 
 
 
309 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  30.32 
 
 
286 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  30.32 
 
 
286 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  29.29 
 
 
297 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  37.32 
 
 
300 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  37.41 
 
 
451 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  25.81 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  34.38 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  33.33 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  38.46 
 
 
467 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  30.38 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  30.4 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  30.58 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  34.78 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  29.5 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  28.29 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  26.95 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  27.33 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  29.63 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  34.51 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  32.09 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  28.78 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  27.5 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  28 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  28 
 
 
355 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  27.14 
 
 
360 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  28.93 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  28.67 
 
 
368 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  28.15 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  29.63 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  30.56 
 
 
342 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  26.67 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  33.61 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  33.64 
 
 
330 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  36.09 
 
 
372 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  29.09 
 
 
358 aa  63.5  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  28.36 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  28.36 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  28.36 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  33.06 
 
 
132 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  32.48 
 
 
367 aa  62.8  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  29.8 
 
 
292 aa  62.4  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  29.63 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  33.02 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  33.09 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  27.95 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  34.17 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  32.21 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  28.57 
 
 
355 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  31.93 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  33.82 
 
 
278 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  27.61 
 
 
310 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 
306 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  25.79 
 
 
477 aa  59.3  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  33.64 
 
 
304 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  27.61 
 
 
310 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  27.61 
 
 
306 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  26.87 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  26.87 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  26.95 
 
 
355 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  24.42 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  27.19 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>