253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2440 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  100 
 
 
298 aa  606  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  69.26 
 
 
299 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  63.09 
 
 
301 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  62.42 
 
 
298 aa  384  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  61.59 
 
 
292 aa  345  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  56.95 
 
 
304 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  56.86 
 
 
297 aa  320  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  55.41 
 
 
307 aa  315  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  51.51 
 
 
298 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  47.68 
 
 
309 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  42 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  41.22 
 
 
300 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  42.2 
 
 
309 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  37.59 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  37.23 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
295 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  36.01 
 
 
306 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  36.75 
 
 
318 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  34.55 
 
 
295 aa  142  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  36.78 
 
 
315 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  34.39 
 
 
306 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  34.64 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
297 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  33.57 
 
 
296 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  30.13 
 
 
316 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
316 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  30.58 
 
 
308 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  32.7 
 
 
321 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 
313 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  31.83 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  31.76 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
313 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  31.31 
 
 
313 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  32.28 
 
 
467 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  28.99 
 
 
286 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  28.99 
 
 
286 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  30.55 
 
 
317 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3656  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.954371  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  30.1 
 
 
302 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  26.37 
 
 
292 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  27.82 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  30.66 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  26.88 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  30.21 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  29.86 
 
 
345 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  27.17 
 
 
342 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  31.17 
 
 
269 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  29.24 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  28.72 
 
 
355 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  27.6 
 
 
342 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  27.8 
 
 
368 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  25.8 
 
 
342 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  29.14 
 
 
354 aa  89  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  26.62 
 
 
321 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  27.57 
 
 
356 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  25.74 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  27.84 
 
 
360 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  27.15 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  27.74 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  29.63 
 
 
307 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  30.63 
 
 
305 aa  87  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  29.29 
 
 
359 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  27.37 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  27.15 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  29.96 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  27.46 
 
 
355 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  28.08 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  28.11 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  27.07 
 
 
451 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  27.18 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  25.27 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  27.74 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  27.74 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  28.67 
 
 
362 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  29.49 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  39.06 
 
 
303 aa  79  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  27.74 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.05 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  25.71 
 
 
347 aa  77  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  25.08 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  29.75 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  28.08 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001536  hydrolases of the alpha/beta superfamily  24.25 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  26.39 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  26.88 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  28.06 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  36.57 
 
 
897 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  26.79 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  33.33 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>