273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1832 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  100 
 
 
299 aa  611  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  69.26 
 
 
298 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  68 
 
 
292 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  64.31 
 
 
301 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  62.71 
 
 
298 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  58.14 
 
 
304 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  60.61 
 
 
297 aa  325  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  55.56 
 
 
307 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  47.64 
 
 
298 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  44.48 
 
 
309 aa  254  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  41.41 
 
 
306 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  39.32 
 
 
300 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  40.69 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  36.04 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  37.06 
 
 
318 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
295 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  34.75 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  34.4 
 
 
295 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  33.21 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  33.8 
 
 
306 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  32.52 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  33.67 
 
 
305 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
296 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  30.94 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  34.05 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
316 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
314 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  32.59 
 
 
321 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  33.05 
 
 
315 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  33.57 
 
 
467 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  27.69 
 
 
316 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  35.42 
 
 
313 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
313 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
313 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  29.32 
 
 
326 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  29.71 
 
 
317 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  31.63 
 
 
307 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
321 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  31.23 
 
 
336 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  27.31 
 
 
286 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  27.31 
 
 
286 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  29.37 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  26.84 
 
 
292 aa  96.3  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 
342 aa  95.9  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  30.48 
 
 
451 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  30.18 
 
 
320 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  30.63 
 
 
362 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  27.8 
 
 
351 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  28.36 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  29.51 
 
 
368 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3656  hypothetical protein  45.28 
 
 
132 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.954371  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  29.23 
 
 
337 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  30.8 
 
 
330 aa  89.4  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.73 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  26.12 
 
 
269 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  29.01 
 
 
356 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  35.86 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  35.86 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  27.41 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  28.19 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  28.1 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  35.86 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  30.53 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  27.8 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  27.48 
 
 
372 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  26.64 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  28.87 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  29.26 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  29.34 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  35.86 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  28.89 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  30.07 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  29.64 
 
 
359 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  27.52 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  28.4 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  28.57 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  28.3 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  26.07 
 
 
346 aa  79  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  26.71 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  28.67 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  30.74 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  43.27 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  32.58 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  26.82 
 
 
318 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  28.41 
 
 
340 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  32.58 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  30.25 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  32.69 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  27.92 
 
 
305 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  27.61 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  40.52 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  28.92 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>