More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6158 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  100 
 
 		 295 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  95.25 
 
 		 295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  57.73 
 
 		 315 aa  341  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  54.27 
 
 		 306 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  54.98 
 
 		 306 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  52.54 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  51.37 
 
 		 316 aa  287  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  49.5 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  43.92 
 
 		 295 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  41.84 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  42.96 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  44.37 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  40.07 
 
 		 318 aa  215  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  38.51 
 
 		 314 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  37.92 
 
 		 316 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  36.82 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  35.99 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  37.71 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.91 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  35.91 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  35.97 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  34.45 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  35.12 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  37.09 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  37.23 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  33 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  36.75 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  34.93 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  35.82 
 
 		 298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  35.82 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  34.27 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  34.64 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  34.4 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  43.36 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  28.47 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  28.47 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  34.4 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  34.63 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  31.16 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  31.56 
 
 		 467 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  28.32 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  25.45 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  31.61 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  27.82 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  35.16 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  27.24 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  32.73 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  34.38 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  30.15 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  23.1 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  29.01 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  27.04 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  32.06 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  26.42 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  28.12 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  26.42 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  31.97 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  28.68 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  22.79 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  24.39 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  35.43 
 
 		 1010 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  25.79 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  29.01 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  34.17 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  25.79 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  25.79 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  25.79 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  25.79 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  28.08 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  24.32 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  25.95 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  32.52 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  25.33 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  32.06 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  23.43 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  26.59 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  31.01 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  27.48 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  28.24 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  25.29 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  27.59 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  31.34 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  25.29 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  27.01 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.01 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  34.65 
 
 		 876 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.77 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  31.11 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  31.11 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  22.83 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  31.34 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  29.46 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>