More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0267 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 
297 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  45.05 
 
 
295 aa  225  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  40.4 
 
 
295 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  40.07 
 
 
295 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  43.88 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  41.81 
 
 
306 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  43.89 
 
 
321 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  37.46 
 
 
295 aa  202  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  42.28 
 
 
295 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  42.28 
 
 
295 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  37.67 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  39.93 
 
 
306 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  42.95 
 
 
317 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  38.1 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  37.54 
 
 
316 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  44.52 
 
 
312 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  37.95 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 
321 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 
313 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 
313 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  37.46 
 
 
308 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  35.12 
 
 
313 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 
302 aa  149  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  37.06 
 
 
299 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  36.75 
 
 
298 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  37.21 
 
 
311 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  32.03 
 
 
298 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  34.86 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  34.12 
 
 
292 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  31.86 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  33.57 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  34.44 
 
 
304 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  33.01 
 
 
298 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  32.5 
 
 
307 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  33.6 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  27.92 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  42.36 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  33.12 
 
 
467 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  30.07 
 
 
286 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  30.07 
 
 
286 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  30.35 
 
 
306 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  40.85 
 
 
451 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  34.91 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  28.95 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  29.7 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  26.04 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  32.47 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.99 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  30.58 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  29.37 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  29.21 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  29.21 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  29.01 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  31.69 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.95 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  25.49 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  31.84 
 
 
347 aa  67  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  35.92 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
868 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  33.77 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  35.92 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  25.19 
 
 
367 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  37.59 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  34.95 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  34.95 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  34.95 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  23.96 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  34.95 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  34.95 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  34.95 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  29.86 
 
 
368 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  36.08 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  31.54 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  31.78 
 
 
301 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  30.14 
 
 
319 aa  63.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  30.22 
 
 
320 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  28.74 
 
 
866 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  24.19 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.51 
 
 
557 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  34.29 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  28.47 
 
 
378 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  28.57 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  30.34 
 
 
378 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  28.57 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  37.93 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  28.57 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  30 
 
 
305 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  36.27 
 
 
282 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  30 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  33.81 
 
 
359 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  28.4 
 
 
342 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  30 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  35.11 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  37.93 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>