187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3047 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  100 
 
 		 355 aa  734    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  77.18 
 
 		 355 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  87.87 
 
 		 305 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  72.19 
 
 		 356 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  66.76 
 
 		 351 aa  503  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  73.42 
 
 		 354 aa  498  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  67.46 
 
 		 360 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  67.16 
 
 		 360 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  73.29 
 
 		 342 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  66.2 
 
 		 345 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  66.76 
 
 		 342 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  66.76 
 
 		 342 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  69.88 
 
 		 342 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  70 
 
 		 321 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  68.63 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  66.19 
 
 		 355 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  63.66 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  59.2 
 
 		 342 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  47.7 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  49.85 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  50.47 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  50.16 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  48.28 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  46.69 
 
 		 346 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  46.46 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  47.15 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  49.05 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  45.17 
 
 		 318 aa  279  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  42.13 
 
 		 348 aa  272  8.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  47.13 
 
 		 320 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  43.59 
 
 		 367 aa  269  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  46.18 
 
 		 368 aa  268  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  44.16 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  43.95 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  41.71 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  44.76 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  41.69 
 
 		 378 aa  249  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  43.27 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  40.21 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  40.67 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  39.58 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  51.88 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  42.12 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  43.57 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  41.27 
 
 		 359 aa  202  7e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  38.32 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  37.34 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  37.66 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  33.44 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  34.14 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  33.96 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  36.89 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  33.45 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  34.28 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  33.1 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  35.4 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  33.1 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  33.96 
 
 		 305 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  33.1 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  32.76 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  32.76 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  32.76 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  32.76 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  32.76 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  33.98 
 
 		 363 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  33.98 
 
 		 363 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  33.77 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  34.26 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  36.21 
 
 		 366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  33.89 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  37 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  36.82 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  33.97 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.17 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  33.99 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  35.06 
 
 		 329 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  32.81 
 
 		 306 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  32.45 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  32.81 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  32.29 
 
 		 310 aa  126  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  35.43 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  32.19 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  35.43 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  33.54 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  42 
 
 		 237 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  32.88 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  32.4 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  35.24 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  31.65 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  27.91 
 
 		 311 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  28.09 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  29.41 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  43.12 
 
 		 132 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  27.8 
 
 		 298 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  28.32 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  27.71 
 
 		 467 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  29.51 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  28.29 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  27.46 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  28.29 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>