156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2905 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  45.67 
 
 
315 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  43.34 
 
 
306 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  43.66 
 
 
306 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  41.84 
 
 
295 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  42.18 
 
 
295 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  46.82 
 
 
295 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  46.42 
 
 
296 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  42.37 
 
 
308 aa  225  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  39.72 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  40.34 
 
 
305 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 
316 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  39.24 
 
 
315 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  42.95 
 
 
312 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  37.46 
 
 
318 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  37.25 
 
 
316 aa  198  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  38.97 
 
 
297 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 
313 aa  172  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 
313 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 
321 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  35.91 
 
 
298 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 
302 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  34.15 
 
 
311 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  34.55 
 
 
321 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  35.74 
 
 
292 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  36.04 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  34.68 
 
 
297 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  33.44 
 
 
307 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  34.55 
 
 
298 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  37.01 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  33.11 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  33.9 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  31.79 
 
 
298 aa  132  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  32.12 
 
 
300 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  31.54 
 
 
309 aa  119  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  39.42 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 
286 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  27.84 
 
 
286 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  29.75 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  36.09 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  31.66 
 
 
451 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  36.69 
 
 
467 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  28.71 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  32.43 
 
 
340 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  31.06 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  37.5 
 
 
282 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.37 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  34.11 
 
 
866 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.82 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  26.67 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
285 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  26.67 
 
 
305 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  31.11 
 
 
292 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  30 
 
 
282 aa  55.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  25.93 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  30.47 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  25.93 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  27.37 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001536  hydrolases of the alpha/beta superfamily  30.86 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  24.84 
 
 
351 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  28.91 
 
 
345 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  30.32 
 
 
362 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  29.23 
 
 
301 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.94 
 
 
285 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  32.23 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  26.39 
 
 
306 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  26.39 
 
 
306 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  26.39 
 
 
306 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  25.62 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  29.56 
 
 
307 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  32.81 
 
 
876 aa  52.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  27.01 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  26.27 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  26.87 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  24.37 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  29.14 
 
 
378 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  27.73 
 
 
132 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  27.21 
 
 
368 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  30.53 
 
 
275 aa  49.7  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  38.24 
 
 
254 aa  49.7  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  26.81 
 
 
359 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8503  putative lipoprotein  34.59 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  25.32 
 
 
360 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  26.75 
 
 
342 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  29.63 
 
 
237 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  25.69 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  25.69 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  33.33 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  25.69 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  31.01 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  27.45 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  29.32 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>