138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4173 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  74.37 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  40.86 
 
 		 451 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  34.58 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  57.14 
 
 		 132 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  30.82 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  30.94 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  30.45 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  30.16 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  30.46 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  29.43 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  30.46 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  30.87 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  29.14 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  38.97 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  28.13 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  25.22 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  37.5 
 
 		 378 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  26.95 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  28.08 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  36.96 
 
 		 237 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  27.65 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  27.33 
 
 		 306 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  28.57 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  29.49 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  29.39 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  26.71 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  38.52 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  26.71 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  37.78 
 
 		 378 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  27.48 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  27.7 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  26.71 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  34.25 
 
 		 364 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  26.95 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  27.69 
 
 		 304 aa  86.3  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  27.6 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  26.38 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  26.38 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  26.38 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  31.64 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  28.24 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  37.59 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  29.37 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  26.82 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  36.96 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  28.07 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  27.8 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  27.21 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  30.77 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  29.79 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  30.71 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  32.12 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  29.26 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  28.21 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  35.88 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  37.4 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  35.88 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  27.27 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  31.16 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  30.34 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  29.38 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  24.05 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  26.52 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  29.29 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  32.67 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  31.75 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  28.68 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  27.59 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  34.07 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.71 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  30.5 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  31.01 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  29.17 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  32.17 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  29.17 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  30.43 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  32.06 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  23.75 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  30.15 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  30.61 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  30.71 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  30 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  22.53 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  22.74 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  32.28 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  26.43 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  22.43 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  27.96 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  29.29 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  28.38 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  31.5 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  24.72 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  23.95 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  31.54 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  22.67 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  31.01 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  29.77 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>