217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2457 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  100 
 
 
337 aa  698    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  85.16 
 
 
342 aa  609  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  73.89 
 
 
342 aa  518  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  72.11 
 
 
342 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  70.92 
 
 
342 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  71.21 
 
 
351 aa  497  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  69.25 
 
 
342 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  70.03 
 
 
360 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  67.26 
 
 
336 aa  487  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  68.24 
 
 
356 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  69.14 
 
 
360 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  71.03 
 
 
321 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  70.72 
 
 
355 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  66.57 
 
 
345 aa  471  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  65.07 
 
 
354 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  63.95 
 
 
355 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  63.66 
 
 
355 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  64.8 
 
 
305 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  51.44 
 
 
347 aa  331  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  47.95 
 
 
330 aa  308  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  47.8 
 
 
346 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  48.12 
 
 
320 aa  298  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  51.56 
 
 
347 aa  295  8e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  46.88 
 
 
329 aa  294  1e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  47.17 
 
 
318 aa  285  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  46.18 
 
 
346 aa  285  8e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  46.86 
 
 
362 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  44.65 
 
 
372 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  47.17 
 
 
320 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  46.37 
 
 
348 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  45.35 
 
 
358 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  45.65 
 
 
368 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  45.37 
 
 
367 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  44.97 
 
 
368 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  43.2 
 
 
359 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  46.27 
 
 
365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  44.2 
 
 
318 aa  245  6.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  41.54 
 
 
378 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  41.54 
 
 
378 aa  235  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  42.09 
 
 
378 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  38.84 
 
 
364 aa  219  5e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  38.76 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  39.63 
 
 
333 aa  215  7e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  37.01 
 
 
302 aa  215  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  42.14 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  43.79 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  49.11 
 
 
237 aa  205  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  38.69 
 
 
303 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  35.9 
 
 
304 aa  192  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  36.01 
 
 
306 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  35.69 
 
 
306 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  35.69 
 
 
306 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  35.69 
 
 
306 aa  186  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  34.7 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  35.28 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  34.7 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  35.05 
 
 
306 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  35.05 
 
 
306 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  35.05 
 
 
306 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  34.08 
 
 
312 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  34.59 
 
 
305 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  33.65 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  34.59 
 
 
305 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  34.28 
 
 
305 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  36.65 
 
 
328 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  33.44 
 
 
307 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  37.58 
 
 
367 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  37 
 
 
366 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  35.14 
 
 
351 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  34.68 
 
 
305 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  35.78 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  34.94 
 
 
363 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  34.94 
 
 
363 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  34.62 
 
 
329 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.78 
 
 
357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  35.13 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  35.13 
 
 
307 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  33.76 
 
 
345 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  42.35 
 
 
237 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  31.46 
 
 
306 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  33.75 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  34.22 
 
 
377 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  32.59 
 
 
306 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  30.82 
 
 
310 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  32.59 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  30.92 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  29.41 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  31.41 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  29.65 
 
 
308 aa  119  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  29.29 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  25.68 
 
 
451 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  26.64 
 
 
298 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  41.48 
 
 
340 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  28.18 
 
 
304 aa  96.3  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  29.76 
 
 
307 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  28.34 
 
 
301 aa  95.9  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  26.88 
 
 
298 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  28.97 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  40.37 
 
 
132 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  30.04 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>