194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4452 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  750    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  81.73 
 
 		 320 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  72.75 
 
 		 368 aa  545  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  78.85 
 
 		 358 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  69.86 
 
 		 367 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  75 
 
 		 368 aa  498  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  65.24 
 
 		 362 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  63.19 
 
 		 348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  68.05 
 
 		 372 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  61.45 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  57.6 
 
 		 378 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  57.31 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  54.49 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  61.83 
 
 		 327 aa  362  7.0000000000000005e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  51.2 
 
 		 346 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  60 
 
 		 359 aa  345  6e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  54.71 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  52.05 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  51.1 
 
 		 320 aa  335  5e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  52.68 
 
 		 346 aa  332  6e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  50.78 
 
 		 318 aa  332  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  50.91 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  47.08 
 
 		 347 aa  318  7.999999999999999e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  47.78 
 
 		 329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  47.92 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  47.44 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  43.34 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  43.1 
 
 		 356 aa  272  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  46.65 
 
 		 345 aa  272  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  45.53 
 
 		 342 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  42.53 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  46.5 
 
 		 355 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  46.84 
 
 		 355 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  45.69 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  43.2 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  43.88 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  42.65 
 
 		 342 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  42.94 
 
 		 342 aa  255  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  45.57 
 
 		 305 aa  255  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  43.15 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  44.27 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  42.21 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  42.61 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  45.37 
 
 		 347 aa  239  6.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  36.84 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  37.09 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  34.1 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  34.58 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  34.84 
 
 		 307 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  34.62 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  33.65 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  38.01 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  32.7 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  33.97 
 
 		 305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  32.04 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  32.91 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  32.91 
 
 		 306 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  32.91 
 
 		 306 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  32.59 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  32.59 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  32.59 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  32.59 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  33.11 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  33.12 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  36.05 
 
 		 305 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  34.81 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  34.81 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  35.64 
 
 		 366 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  33.23 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  35.05 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  34 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  33.55 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  32.91 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  33.55 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  37.36 
 
 		 237 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  33.55 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  33.12 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  36.87 
 
 		 237 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  32.67 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  33.67 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  33.55 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  31.44 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  29.97 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.49 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  32.91 
 
 		 307 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  31.6 
 
 		 322 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  32.91 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  30.58 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  29.6 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  29.61 
 
 		 451 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  33.77 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  29.1 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  28.85 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  29.58 
 
 		 309 aa  90.5  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  27.09 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  27.04 
 
 		 297 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  42.06 
 
 		 132 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  29.29 
 
 		 298 aa  85.9  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4838  hypothetical protein  68.33 
 
 		 60 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>