210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1971 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  45.93 
 
 
302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  43.1 
 
 
312 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  43.93 
 
 
301 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  44.77 
 
 
303 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  40.06 
 
 
305 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  42.05 
 
 
304 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  42.91 
 
 
347 aa  215  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  39.42 
 
 
305 aa  215  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  41.5 
 
 
304 aa  215  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  38.39 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  38.46 
 
 
306 aa  211  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  38.46 
 
 
306 aa  211  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  39.62 
 
 
305 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  39.74 
 
 
305 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  38.14 
 
 
306 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  38.14 
 
 
306 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  37.82 
 
 
310 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  37.82 
 
 
306 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  37.82 
 
 
306 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  37.82 
 
 
310 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  38.59 
 
 
329 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  38.96 
 
 
346 aa  192  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  43.69 
 
 
363 aa  188  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  43.69 
 
 
363 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  43.69 
 
 
329 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  38.26 
 
 
372 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  36.58 
 
 
318 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  36.45 
 
 
346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  36.45 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  41.88 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  35.28 
 
 
351 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  35.91 
 
 
330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  34.5 
 
 
337 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  37.62 
 
 
336 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  38.83 
 
 
355 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  36.89 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  37.66 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  33.87 
 
 
342 aa  179  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  37.58 
 
 
345 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  41.37 
 
 
352 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  35.16 
 
 
356 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  36.89 
 
 
355 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  35.55 
 
 
342 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  39.03 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  40.91 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  35.35 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  34.84 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  36.22 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  34.19 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  36.89 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  35.88 
 
 
345 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  36.01 
 
 
354 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  37.29 
 
 
342 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40 
 
 
357 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  39.74 
 
 
367 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  35.86 
 
 
326 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  39.35 
 
 
307 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  36.01 
 
 
348 aa  166  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  39.81 
 
 
328 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  39.35 
 
 
307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  39.81 
 
 
366 aa  165  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  34.42 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  35.81 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  34.84 
 
 
359 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  34.2 
 
 
355 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  35.99 
 
 
358 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  34.63 
 
 
320 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  34.44 
 
 
310 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  38.26 
 
 
310 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  35.64 
 
 
321 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  37.23 
 
 
322 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  35.56 
 
 
368 aa  152  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  37.62 
 
 
310 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  45.4 
 
 
237 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  34.82 
 
 
367 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  35.28 
 
 
365 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  35.91 
 
 
306 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  37.34 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  34.5 
 
 
364 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  35.29 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  35.64 
 
 
308 aa  146  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  33.68 
 
 
311 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  33.95 
 
 
378 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  36.08 
 
 
451 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  33.44 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  33.75 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  34.64 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  33.22 
 
 
359 aa  125  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  32.71 
 
 
333 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  31.49 
 
 
292 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  31.97 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  31.97 
 
 
309 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  28.57 
 
 
309 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  30.49 
 
 
340 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  31.19 
 
 
297 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  31.49 
 
 
298 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  29.39 
 
 
298 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  30.13 
 
 
292 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  30.95 
 
 
298 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>