167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  100 
 
 
333 aa  696    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  67.66 
 
 
359 aa  433  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  57.19 
 
 
368 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  57.14 
 
 
320 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  57.58 
 
 
368 aa  351  8.999999999999999e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  55.95 
 
 
372 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  54.71 
 
 
367 aa  346  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  54.71 
 
 
359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  53.89 
 
 
358 aa  339  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  54.19 
 
 
362 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  51.16 
 
 
378 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  50.86 
 
 
378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  49.13 
 
 
378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  52.91 
 
 
365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  50.15 
 
 
348 aa  314  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  54.01 
 
 
327 aa  311  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  44.48 
 
 
347 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  42.68 
 
 
320 aa  263  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  43.94 
 
 
346 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.79 
 
 
346 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  42.81 
 
 
318 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  43.32 
 
 
364 aa  248  7e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  41.23 
 
 
330 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  38.46 
 
 
329 aa  235  8e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  43.56 
 
 
342 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  40.18 
 
 
342 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  38.96 
 
 
351 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  39.63 
 
 
337 aa  215  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  39.02 
 
 
342 aa  212  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  39.88 
 
 
321 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  38.89 
 
 
342 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  43.17 
 
 
318 aa  211  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  39.69 
 
 
336 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  38.96 
 
 
356 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  38.89 
 
 
342 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  40.37 
 
 
354 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  41.12 
 
 
347 aa  203  4e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  39.81 
 
 
305 aa  202  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  38.15 
 
 
360 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  38.02 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  37.23 
 
 
360 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  39.52 
 
 
345 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  38.32 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  39.69 
 
 
355 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  33.87 
 
 
305 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  32.91 
 
 
305 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  33.22 
 
 
302 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  33.33 
 
 
305 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  32.81 
 
 
303 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  33.66 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  33.75 
 
 
306 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  33.75 
 
 
306 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  33.75 
 
 
306 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  33.44 
 
 
306 aa  142  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  33.44 
 
 
306 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  33.13 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  33.13 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  33.13 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  33.13 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  36.61 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  32.91 
 
 
301 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  31.71 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  33.97 
 
 
307 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  33.97 
 
 
307 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  33.65 
 
 
351 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  31.68 
 
 
312 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  34.66 
 
 
310 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  34.86 
 
 
377 aa  122  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  35.67 
 
 
306 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  34.5 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  35.35 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  32.89 
 
 
366 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  32.43 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  34.39 
 
 
308 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  32.19 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  33.99 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.88 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  32.09 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  34.63 
 
 
367 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  32.15 
 
 
345 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  31.75 
 
 
322 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  41.33 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  31.43 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  33.88 
 
 
329 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  33.88 
 
 
363 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  33.88 
 
 
363 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  39.01 
 
 
237 aa  106  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  29.54 
 
 
311 aa  99.4  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  30.1 
 
 
451 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  45.38 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  41.27 
 
 
340 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  29.37 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  44 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  36.76 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  25.17 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  37.6 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  35.37 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  29.69 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  37.9 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>