180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0722 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  754    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  74.61 
 
 		 367 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  70.99 
 
 		 359 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  73.98 
 
 		 320 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  72.31 
 
 		 358 aa  494  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  69.66 
 
 		 368 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  70.06 
 
 		 372 aa  454  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  64.57 
 
 		 362 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  66.13 
 
 		 348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  60.28 
 
 		 365 aa  423  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  56.99 
 
 		 378 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  54.31 
 
 		 378 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  57.22 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  58.18 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  61.2 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  57.51 
 
 		 359 aa  355  5.999999999999999e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  52.19 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  51.89 
 
 		 330 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  50.78 
 
 		 318 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  50 
 
 		 320 aa  326  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  50.63 
 
 		 347 aa  326  5e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  49.39 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  48.94 
 
 		 346 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  47.5 
 
 		 329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  46.67 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  43.93 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  46.67 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  44.97 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  46.67 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  44.44 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  45.15 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  45.71 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  45.71 
 
 		 355 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  45.86 
 
 		 336 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  45.54 
 
 		 342 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  46.33 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  44.76 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  44.13 
 
 		 355 aa  262  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  43.53 
 
 		 342 aa  262  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  45.39 
 
 		 305 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  44.13 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  42.86 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  42.22 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  46.37 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  37.1 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  35.56 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  34.98 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  33.55 
 
 		 306 aa  159  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  33.22 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  33.22 
 
 		 306 aa  155  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  33.22 
 
 		 306 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  32.57 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  32.57 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  32.57 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  32.57 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  37.25 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  36.51 
 
 		 303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  36.17 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  34.83 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  35.47 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  35.47 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  35.47 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  32.25 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  36.68 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  34.92 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  32.28 
 
 		 305 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  35.76 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  31.96 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.95 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  32.28 
 
 		 305 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  35.59 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  31.96 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  32.36 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  40.23 
 
 		 237 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  34.07 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.508552 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  45.81 
 
 		 237 aa  124  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  34.29 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  34.34 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  33.23 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  35.27 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  33.89 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  30.25 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  31.6 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  31.96 
 
 		 310 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  32.19 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  33.45 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  34.1 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  33.45 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  29.53 
 
 		 451 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  30.26 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  30.27 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  27.6 
 
 		 319 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  45 
 
 		 132 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  27.91 
 
 		 301 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  27.45 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  30.04 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4838  hypothetical protein  64.41 
 
 		 60 aa  82.8  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  28.92 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  38.02 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>