61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4838 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4838  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  69.49 
 
 		 362 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  68.33 
 
 		 359 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  69.49 
 
 		 372 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  66.1 
 
 		 320 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  67.8 
 
 		 365 aa  84.3  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  66.1 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  64.41 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  65 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  63.33 
 
 		 368 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  67.8 
 
 		 356 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  67.8 
 
 		 347 aa  81.3  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  65.57 
 
 		 320 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  61.67 
 
 		 355 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  62.71 
 
 		 346 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  61.02 
 
 		 342 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  57.63 
 
 		 358 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  62.71 
 
 		 346 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  64.41 
 
 		 368 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  59.32 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  62.71 
 
 		 321 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  58.33 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  55.93 
 
 		 318 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  57.63 
 
 		 342 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  55.93 
 
 		 342 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  57.63 
 
 		 337 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  59.02 
 
 		 329 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  57.63 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  55.93 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  55.93 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  60 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  52.54 
 
 		 305 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  55.93 
 
 		 342 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  52.54 
 
 		 345 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  60.66 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  54.24 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  50.85 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  50.85 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  51.67 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  53.33 
 
 		 364 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  52.54 
 
 		 355 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  50 
 
 		 378 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  50 
 
 		 378 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  49.18 
 
 		 347 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  44.78 
 
 		 333 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  50 
 
 		 305 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  50 
 
 		 305 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  46.34 
 
 		 302 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35460  hypothetical protein  51.52 
 
 		 37 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  47.62 
 
 		 305 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  47.62 
 
 		 305 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  42.37 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  38.98 
 
 		 310 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  38.98 
 
 		 310 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  38.98 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  38.71 
 
 		 306 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  38.71 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  38.98 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  51.22 
 
 		 307 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  38.98 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  38.98 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>