181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000424 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  100 
 
 
367 aa  767    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  72.78 
 
 
368 aa  558  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  75.62 
 
 
320 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  69.86 
 
 
359 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  74.61 
 
 
368 aa  509  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  69.68 
 
 
358 aa  495  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  69.23 
 
 
348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  67.17 
 
 
372 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  62.39 
 
 
362 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  63.31 
 
 
365 aa  436  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  57.81 
 
 
378 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  55.23 
 
 
378 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  57.76 
 
 
378 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  62.15 
 
 
327 aa  362  4e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  60.56 
 
 
359 aa  361  1e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  55.49 
 
 
346 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  56.05 
 
 
330 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  54.71 
 
 
333 aa  346  4e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  52.34 
 
 
318 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  55.66 
 
 
320 aa  344  1e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  54.63 
 
 
346 aa  340  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  54.29 
 
 
347 aa  335  5e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  50.89 
 
 
364 aa  318  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  52.04 
 
 
329 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  45.74 
 
 
351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  47.91 
 
 
336 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  46.96 
 
 
356 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  45.69 
 
 
342 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  47.28 
 
 
354 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  48.05 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  46.65 
 
 
342 aa  272  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  44.73 
 
 
345 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  44.05 
 
 
342 aa  270  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  43.23 
 
 
355 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  43.9 
 
 
355 aa  268  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  45.69 
 
 
321 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  46.01 
 
 
342 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  45.37 
 
 
337 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  46.33 
 
 
355 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  45.37 
 
 
342 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  41.13 
 
 
360 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  41.9 
 
 
360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  46 
 
 
305 aa  255  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  45.8 
 
 
347 aa  253  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  36.27 
 
 
302 aa  175  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  33.11 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  33.99 
 
 
303 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  33.22 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  33.22 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  33.45 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  33.87 
 
 
307 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  33.1 
 
 
306 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  33.1 
 
 
306 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  33.1 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  33.56 
 
 
306 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  33.56 
 
 
306 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  32.41 
 
 
306 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  33.23 
 
 
304 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  33.54 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  34.56 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  32.59 
 
 
305 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  34.56 
 
 
363 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  35.89 
 
 
329 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  32.91 
 
 
305 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  35.65 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  37.21 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  35.31 
 
 
328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  34.25 
 
 
304 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  32.49 
 
 
305 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  37.21 
 
 
352 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  32.58 
 
 
345 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  34.58 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  43.59 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  34.49 
 
 
306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  34.49 
 
 
306 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  34.88 
 
 
367 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.04 
 
 
357 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  34.92 
 
 
310 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  38.37 
 
 
237 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  33.67 
 
 
377 aa  116  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  32.06 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  31.33 
 
 
306 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  30.94 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  33.22 
 
 
326 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  29.97 
 
 
322 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  31.29 
 
 
307 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  32.2 
 
 
307 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  28.18 
 
 
451 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  32.23 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  39.34 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  27.86 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  28.21 
 
 
298 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  29.22 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  27.8 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  26.87 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4838  hypothetical protein  66.1 
 
 
60 aa  82.8  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  28.07 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  25.31 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  42 
 
 
132 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>