212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2980 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 342 aa  706    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  90.97 
 
 		 321 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  74.56 
 
 		 342 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  76.32 
 
 		 342 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  73.1 
 
 		 342 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  76.04 
 
 		 336 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  72.65 
 
 		 360 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  72.06 
 
 		 360 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  73.83 
 
 		 356 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  70.35 
 
 		 351 aa  508  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  74.54 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  70.67 
 
 		 345 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  69.25 
 
 		 337 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  67.84 
 
 		 342 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  68.13 
 
 		 354 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  69.88 
 
 		 355 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  69.28 
 
 		 355 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  70.82 
 
 		 305 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  50.48 
 
 		 347 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  50.31 
 
 		 346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  50.32 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  47.95 
 
 		 330 aa  315  6e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  49.42 
 
 		 347 aa  311  7.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  46.88 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  46.56 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  45.28 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  43.86 
 
 		 368 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  46.18 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  45.69 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  46.84 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  45.14 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  44.76 
 
 		 372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  45.53 
 
 		 359 aa  268  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  44.44 
 
 		 368 aa  265  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  48.42 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  42.56 
 
 		 358 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  44.97 
 
 		 318 aa  255  8e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  42.36 
 
 		 378 aa  255  9e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  46.27 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  45.07 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  54.51 
 
 		 237 aa  236  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  40.92 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  43.35 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  45.31 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  40.18 
 
 		 333 aa  220  3.9999999999999997e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  39.74 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  39.94 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  38.14 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  34.84 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  34.52 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  34.52 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  34.52 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  34.62 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  33.87 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  33.87 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  33.87 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  33.55 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  33.87 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  34.19 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  36.51 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  36.18 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  35.86 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  36.18 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  38.69 
 
 		 367 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  36.05 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.49 
 
 		 357 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  33.33 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  38.08 
 
 		 351 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  36.51 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  34.92 
 
 		 363 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  34.92 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  35.28 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  34.92 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  33.22 
 
 		 304 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  36.3 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  35.12 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  35.33 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  35.33 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  33.85 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  34.47 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  33.66 
 
 		 377 aa  141  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  41.28 
 
 		 237 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  35.02 
 
 		 307 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  33.64 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  32.67 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  34.7 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  31.35 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  28.66 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  30.82 
 
 		 326 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  42.62 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  27.4 
 
 		 451 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  27.11 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  43.52 
 
 		 132 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  28.88 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  27.74 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  28.91 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  26.87 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  26.67 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  27.52 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>