208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1979 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  100 
 
 		 311 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  71.2 
 
 		 310 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  70.23 
 
 		 322 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  63.64 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  58.9 
 
 		 306 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  59.26 
 
 		 306 aa  358  9e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  59.26 
 
 		 306 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  55.66 
 
 		 308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  45.98 
 
 		 305 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  46.3 
 
 		 305 aa  299  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  45.98 
 
 		 305 aa  298  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  45.34 
 
 		 305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  47.91 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  46.1 
 
 		 305 aa  272  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  45.98 
 
 		 307 aa  258  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  45.98 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  41.53 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  40.58 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  38.73 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  38.17 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  37.34 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  37.34 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  36.39 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  36.39 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  39.24 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  35.87 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  36.71 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  36.71 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  36.71 
 
 		 310 aa  198  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  36.71 
 
 		 310 aa  198  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  35.22 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  41.31 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  30.65 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  34.6 
 
 		 347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  30.48 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  29.75 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  29.41 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  34.06 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  28.66 
 
 		 342 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  29.14 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  29.11 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  28.39 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  26.5 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  29.34 
 
 		 355 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  28.17 
 
 		 356 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  29.28 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  28.21 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  31.86 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  33.93 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  28.3 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  28.35 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  26.81 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  28.3 
 
 		 342 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  33.75 
 
 		 377 aa  135  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  34.18 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  29.47 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  31.68 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  27.91 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.07 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  29.6 
 
 		 359 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  29.21 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  27.59 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  30.32 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  27.24 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  31.97 
 
 		 367 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  30.06 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  27.73 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  32.09 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  28.57 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  28.57 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  28.62 
 
 		 348 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  27.1 
 
 		 351 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  29.54 
 
 		 333 aa  119  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  30.33 
 
 		 368 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  30.72 
 
 		 378 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  31.96 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  31.96 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  31.96 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  27.86 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.27 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  29.35 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  29.15 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  29.19 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  27.3 
 
 		 318 aa  108  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  31.99 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  28.66 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  27.79 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  26.54 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  28.93 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  37.38 
 
 		 132 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  29.12 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1030  hypothetical protein  44.87 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1109  hypothetical protein  44.87 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  27.18 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  27.39 
 
 		 451 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  34.84 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  31.29 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  35.48 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  33.33 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>