246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2979 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  618  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  43.09 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  43.69 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  41.22 
 
 		 298 aa  224  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  39.32 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  39.72 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  40.69 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  36.73 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  36.72 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  41.22 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  37.67 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  40.67 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  34.27 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  30.43 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  35.06 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  34.66 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  30.77 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  32.12 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  30.39 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  26.64 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  26.57 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  29.11 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  31.58 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  36.24 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  31.27 
 
 		 451 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  29.88 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  28.42 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  32.49 
 
 		 467 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  28.52 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  29.15 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  28.52 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  29.01 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  29.26 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  27.81 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  32.07 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  27.03 
 
 		 342 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  27.39 
 
 		 355 aa  90.5  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  27.6 
 
 		 355 aa  90.5  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  27.8 
 
 		 345 aa  90.1  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  27.87 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  26.49 
 
 		 351 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  25.58 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  26.33 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  27.91 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  38.52 
 
 		 378 aa  85.9  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  26.51 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  37.7 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  36.89 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  26 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  27.24 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  26.56 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  27.54 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  28.23 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  36.67 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  27.8 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  26.69 
 
 		 362 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  25.68 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  26.76 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  26.58 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  24.67 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  26.47 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  28.67 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  24.75 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  33.33 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  26.26 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  25.86 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  35.34 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  26.28 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  34.17 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  26.28 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  36.36 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.9 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  26.4 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  36.21 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  34.69 
 
 		 132 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  27.66 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  25.94 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3656  hypothetical protein  36.46 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.954371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  31.67 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  31.15 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  32 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  28.87 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  28.87 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  28.87 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  24.42 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  28.87 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  32.14 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>