127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001536 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001536  hydrolases of the alpha/beta superfamily  100 
 
 
297 aa  609  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  29.29 
 
 
467 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  26.37 
 
 
292 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  24.29 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  24.29 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  24.25 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  25.85 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  25.54 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  23.81 
 
 
304 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 
313 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  23.27 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  26.43 
 
 
313 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  23.26 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  24.58 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35.14 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  24 
 
 
292 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  21.97 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  20.79 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  32.17 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  24.92 
 
 
255 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  22.85 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  31.3 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.61 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  30.86 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  22.18 
 
 
254 aa  53.1  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  26.87 
 
 
345 aa  52.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  28.07 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  31.36 
 
 
315 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  22.1 
 
 
284 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  25.6 
 
 
253 aa  52.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  22.1 
 
 
293 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 
295 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 
295 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
302 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  22.1 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  22.1 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  22.1 
 
 
284 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  32.73 
 
 
132 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  22.1 
 
 
293 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  22.37 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  22.68 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  31.71 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  23.32 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  23.32 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  23.32 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  25 
 
 
567 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  25 
 
 
572 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
314 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  21.72 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  23.43 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  29.67 
 
 
295 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  22.06 
 
 
368 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  30.4 
 
 
237 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  33.04 
 
 
311 aa  49.3  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  23.9 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  26.72 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  32.31 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  21.52 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  33.64 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  29.67 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  24.64 
 
 
572 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.91 
 
 
572 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  22.85 
 
 
367 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  28.68 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  25.19 
 
 
355 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  22.46 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  22.64 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  39.51 
 
 
814 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  29.91 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  34.44 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  25.74 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  28.69 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2009  dienelactone hydrolase  30.83 
 
 
310 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  29.29 
 
 
257 aa  47  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.9 
 
 
285 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  22.5 
 
 
358 aa  46.2  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  22.61 
 
 
359 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24.78 
 
 
286 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  22.68 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  30.94 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.34 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  39.06 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  22.18 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  34.62 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  27.27 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  34.43 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  30.08 
 
 
638 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  24.34 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  23.69 
 
 
354 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  26.55 
 
 
355 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>