More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0891 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  67.4 
 
 		 273 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  30.8 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.35 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  29.96 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.43 
 
 		 261 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  29.46 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.97 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3004  peptidase S15  32.34 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0110068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  27.05 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  26.89 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  34.65 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  27.66 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  27.84 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  27.66 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  27.66 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  26.75 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  29.44 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  31.44 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.57 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0085  hypothetical protein  26.09 
 
 		 284 aa  62  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720281  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  29.18 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  23.73 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.67 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  24.49 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  24.6 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  27.92 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  27.36 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  23.36 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  31.45 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  35.14 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  34.91 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  25.94 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  42.06 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.51 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  30.12 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  32.14 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  32.11 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.34 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  25.62 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  24.26 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  26.91 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  32.14 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  23.61 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.9 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  25.68 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  29.82 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  27.35 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  25.55 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  28.1 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  24.06 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  29.84 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  41.25 
 
 		 409 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  26.38 
 
 		 259 aa  52.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  26.12 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  21.94 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  26.19 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.31 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  26.19 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  26.43 
 
 		 460 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  27.71 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  25.86 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  35.16 
 
 		 477 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  38.68 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  28.44 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1702  hypothetical protein  30.22 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.412108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 		 361 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  26.27 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.19 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>