More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1500 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  100 
 
 		 307 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  99.3 
 
 		 286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  94.79 
 
 		 307 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  92.83 
 
 		 307 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  76.43 
 
 		 304 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  70.59 
 
 		 298 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  68.17 
 
 		 298 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  72.51 
 
 		 301 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  73.51 
 
 		 301 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  69.4 
 
 		 297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  65 
 
 		 295 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  42.53 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  39.48 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  39.39 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  34.27 
 
 		 276 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  34.11 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  30.27 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  33.47 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  29.93 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  29.93 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  29.93 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  28.73 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  28.98 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  28.73 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  28.98 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  35.55 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  28.73 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  28.73 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  28.73 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  28.73 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  28.62 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  33.59 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  39.04 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  39.04 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  31.76 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  28.79 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  27.89 
 
 		 270 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  40.69 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  28.41 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  30.53 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  28.92 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  29.34 
 
 		 287 aa  89.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  29.1 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  29.51 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  28.04 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  32.56 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  31.82 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  27.94 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  32.48 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  35.81 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  30.52 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  31.9 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  26.58 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  32.58 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  34.36 
 
 		 424 aa  79.3  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  25.88 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  31.58 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  29.58 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  27.06 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.4 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  30.3 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  26.32 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  29.58 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  26.52 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  32.57 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  28.94 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  29.89 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  31.44 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  27.1 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  31.31 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  29.57 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  29.91 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  29 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  27.8 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.87 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  35.67 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  29.03 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  29.53 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  32.87 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  25.86 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  28.76 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02210  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.62 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.12 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  35.25 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.2 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0187  hypothetical protein  25.89 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  23.4 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.81 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  25.38 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  27.04 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  23.72 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  29.07 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  33.33 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.8 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>