More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1314 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  100 
 
 		 298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  89.93 
 
 		 298 aa  557  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  71.43 
 
 		 286 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  73.09 
 
 		 307 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  72.36 
 
 		 307 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  71.64 
 
 		 307 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  72.83 
 
 		 304 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  68.04 
 
 		 301 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  66.79 
 
 		 297 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  67.91 
 
 		 301 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  67.55 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  42.53 
 
 		 267 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  39.48 
 
 		 296 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  39.34 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  32.1 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  32.1 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  32.1 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  30.99 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  32.1 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  30.99 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  32.1 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  32.1 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  30.88 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  31.46 
 
 		 292 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  31.7 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  34.7 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  31.7 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  31.7 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  33.88 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  35.69 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  32.59 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  32.37 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  32.05 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  29.34 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  32.22 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  30.16 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  28.68 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  29.63 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  28.96 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  29.29 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  32.31 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  32.2 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  37.93 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  30.92 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  28.43 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  29.64 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  27.73 
 
 		 303 aa  96.7  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  36.28 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  29.15 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  26.77 
 
 		 265 aa  93.2  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  32.27 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  31.72 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  33.64 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  30 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.48 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  25.6 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  26.39 
 
 		 265 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  26.29 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  28.52 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  30.52 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  27.54 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  29.25 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  30.08 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  25.7 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  28.3 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.62 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  30.16 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  25.48 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  28.23 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  27.9 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  33.01 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  29.5 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3153  hypothetical protein  32.24 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.913787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  32.9 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.35 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  29.85 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0187  hypothetical protein  27.05 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.44 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  23.68 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  27.64 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.97 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  30.29 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  28.96 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  29.26 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  28.35 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  31.48 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  29.58 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  26.34 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  31.65 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.42 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  28.76 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1061  temperature sensitive supressor-like protein  28.16 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.133168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  27.32 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  26.11 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  29.38 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  22.5 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>