201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1999 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  100 
 
 
424 aa  816    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0134  hypothetical protein  50.41 
 
 
126 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746093  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  27.13 
 
 
294 aa  99.8  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  29.93 
 
 
312 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.82 
 
 
314 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  28.2 
 
 
292 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  32.69 
 
 
305 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  27.68 
 
 
309 aa  90.5  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  27.86 
 
 
313 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.89 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  25.83 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  34.11 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  34.36 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  25.99 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  25.72 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.74 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.64 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.47 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.34 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  27.89 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  33.95 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  32.52 
 
 
307 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  29.46 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  27.92 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  25.77 
 
 
347 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  24.69 
 
 
290 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  36.03 
 
 
301 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  33.87 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  30.81 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24.79 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  41.67 
 
 
467 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  27.44 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.05 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  26.56 
 
 
311 aa  67  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  23.1 
 
 
309 aa  67  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  31.79 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  34.07 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  22.22 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  21.83 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  25.49 
 
 
282 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  26.92 
 
 
278 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  31.85 
 
 
304 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.9 
 
 
285 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.26 
 
 
297 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.5 
 
 
302 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.03 
 
 
280 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  25.72 
 
 
283 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  31.13 
 
 
290 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  33.79 
 
 
281 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  25.41 
 
 
284 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  28.57 
 
 
307 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  22.36 
 
 
325 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0385  hypothetical protein  40.38 
 
 
256 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  31.94 
 
 
295 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  22.8 
 
 
311 aa  58.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  24.92 
 
 
359 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.47 
 
 
319 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  27.27 
 
 
292 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  36.61 
 
 
274 aa  57.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  24.32 
 
 
337 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.72 
 
 
259 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 
255 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 
295 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  27.27 
 
 
292 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  27.27 
 
 
292 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 
295 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  27.27 
 
 
292 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  25.39 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  35.61 
 
 
321 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  23.36 
 
 
308 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  32.14 
 
 
315 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  27.31 
 
 
287 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  27.98 
 
 
307 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  25.9 
 
 
276 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  32.12 
 
 
292 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  26.49 
 
 
294 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  37.3 
 
 
279 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  36.94 
 
 
345 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  24.32 
 
 
284 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  28.81 
 
 
271 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  22.57 
 
 
307 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  22.57 
 
 
307 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  22.57 
 
 
307 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  22.57 
 
 
307 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  24.32 
 
 
284 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  22.57 
 
 
307 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  22.57 
 
 
307 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  22.06 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  28.18 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  27.4 
 
 
282 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  26.51 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  31.48 
 
 
490 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  24.06 
 
 
293 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  42.86 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
297 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  24.06 
 
 
293 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  23.84 
 
 
284 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  34.56 
 
 
313 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  23.84 
 
 
284 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>