291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0234 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
256 aa  517  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  43.82 
 
 
413 aa  201  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  41.32 
 
 
405 aa  197  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  44.35 
 
 
410 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  41.15 
 
 
402 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  41.32 
 
 
258 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  37.94 
 
 
256 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  44.78 
 
 
423 aa  185  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  42.15 
 
 
415 aa  185  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  40.78 
 
 
410 aa  185  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  45.04 
 
 
409 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  41.9 
 
 
412 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  43.9 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  45.04 
 
 
406 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  45.04 
 
 
406 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  45.04 
 
 
406 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  39.61 
 
 
410 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  40.78 
 
 
408 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  44.35 
 
 
405 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  48.26 
 
 
407 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  45.29 
 
 
407 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  43.44 
 
 
257 aa  175  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  39.32 
 
 
251 aa  175  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  40.66 
 
 
259 aa  175  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  42.74 
 
 
405 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  42.98 
 
 
397 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  42.56 
 
 
257 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  42.32 
 
 
409 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  38.43 
 
 
406 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  36.64 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  46.29 
 
 
408 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  43.33 
 
 
259 aa  158  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  45.85 
 
 
408 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  36.51 
 
 
259 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  45 
 
 
418 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  36.29 
 
 
250 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  34.78 
 
 
250 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  40.28 
 
 
145 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  32.79 
 
 
411 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.99 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  30.69 
 
 
253 aa  79  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  28.97 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  31.2 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  23.79 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.65 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  26.37 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  26.81 
 
 
274 aa  62.8  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  23.79 
 
 
205 aa  63.2  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  27.47 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  27.68 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.45 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  30.48 
 
 
271 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  26.94 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  26.29 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.23 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  26.13 
 
 
294 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  23.08 
 
 
292 aa  58.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  34.78 
 
 
302 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  24.28 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  30.48 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  26.84 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  25.46 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  27.32 
 
 
294 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.46 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.22 
 
 
306 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  30.41 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  34.65 
 
 
218 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  27.42 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  28.81 
 
 
301 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  27.8 
 
 
269 aa  55.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  24.55 
 
 
298 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  37.65 
 
 
636 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  29.56 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  27.47 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  23.15 
 
 
277 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  25.45 
 
 
307 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  31.68 
 
 
595 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  26.4 
 
 
298 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  24.58 
 
 
296 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  40.22 
 
 
473 aa  52.4  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  24.56 
 
 
355 aa  52  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  25.69 
 
 
293 aa  52  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  30.48 
 
 
251 aa  52  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  25 
 
 
304 aa  52  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  33.33 
 
 
465 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  25.38 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.11 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  37.7 
 
 
357 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  32.03 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  38.64 
 
 
374 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  28.5 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  23.14 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>