More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5147 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  60.13 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  60.84 
 
 		 285 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  61.4 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  58.57 
 
 		 293 aa  325  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  60.45 
 
 		 294 aa  322  8e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  62.6 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  45.83 
 
 		 294 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  42.91 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  41 
 
 		 294 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  42 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  42.54 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  39.93 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  37.93 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  39.3 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  34.86 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  38.18 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  35.51 
 
 		 307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  34.78 
 
 		 307 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  34.64 
 
 		 287 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  36.65 
 
 		 285 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  32.93 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  31.99 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  33.22 
 
 		 276 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  31.88 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  38.46 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  34.11 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  40.1 
 
 		 282 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  34.89 
 
 		 282 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  36.33 
 
 		 286 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  31.15 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  31.2 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  29.7 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  31.09 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  33.88 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  31.56 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  35.97 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  35.97 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  35.97 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  28.96 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  28.57 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.71 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  31.23 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  34.4 
 
 		 279 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  31.17 
 
 		 266 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  30 
 
 		 284 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  29.84 
 
 		 284 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  25.21 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  24.79 
 
 		 265 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  29.44 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  29.08 
 
 		 284 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  29.08 
 
 		 284 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  29.08 
 
 		 293 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  29.08 
 
 		 293 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  31.3 
 
 		 297 aa  93.2  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  27.6 
 
 		 284 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  32.8 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  30.4 
 
 		 284 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  30.04 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  27.48 
 
 		 292 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  31.76 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  33.48 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  30.15 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  30.2 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.45 
 
 		 286 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  23.6 
 
 		 267 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  29 
 
 		 301 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  27.94 
 
 		 292 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  27.94 
 
 		 292 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  27.94 
 
 		 292 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1061  temperature sensitive supressor-like protein  28.85 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.133168  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  29.66 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  30 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  29.91 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  32.68 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  27.94 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.18 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  29.57 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  28.68 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.08 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  33.91 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  24.45 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  30.08 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  29.15 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  22.53 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  24.18 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  22.53 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  21.65 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  21.84 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  32.84 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  26.97 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  21.58 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  21.58 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  21.58 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  28.87 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  21.58 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  21.58 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  21.92 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  29.6 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>