More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2116 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  39.22 
 
 
290 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  41.55 
 
 
306 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  39.93 
 
 
307 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  39.66 
 
 
295 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  39.57 
 
 
307 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  37.86 
 
 
287 aa  182  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  42.86 
 
 
294 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  38.91 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  38.66 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  36.64 
 
 
314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  37.16 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  38.3 
 
 
314 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  41.1 
 
 
276 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  35.42 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  34.51 
 
 
293 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  33.56 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  36.33 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  33.05 
 
 
324 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  32.98 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  35.38 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  31.52 
 
 
295 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  30.07 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  38.14 
 
 
278 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  32.75 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  29.71 
 
 
265 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  32.56 
 
 
277 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  30.74 
 
 
332 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  30.58 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  35.54 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  33.73 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  35.07 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  40.98 
 
 
292 aa  112  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  35.8 
 
 
279 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  31.01 
 
 
271 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  28.08 
 
 
315 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  29.93 
 
 
276 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  35 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  32.4 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  32.39 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  31.67 
 
 
301 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  34.42 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  34.42 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  34.42 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  31.28 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  28 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  32.42 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  32.7 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  34.06 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  28.93 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  28.09 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  30.1 
 
 
298 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  31.68 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  28.04 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  31.85 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.07 
 
 
302 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  25.69 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  29.66 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3153  hypothetical protein  32.54 
 
 
257 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.913787  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  27.93 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  30.37 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  28.38 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.43 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  32.58 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  27.93 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  30.3 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  30.31 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  27.93 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  27.93 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  27.93 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.09 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  27.93 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  32.16 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28215  predicted protein  32.8 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  27.48 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.72 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  30.61 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.7 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  26.72 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  30.99 
 
 
299 aa  79  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  28.16 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  29.66 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  28.16 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  28.16 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  29.01 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  27.92 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  26.16 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  27.76 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  22.61 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  29.65 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.26 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3869  hypothetical protein  28.64 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  25.42 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  31.48 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  24.42 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  35.67 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4186  putative alpha/beta superfamily hydrolase  30.19 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0367374  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2845  temperature sensitive supressor-like  27.85 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>