153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1447 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  100 
 
 
285 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  83.1 
 
 
319 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3566  hypothetical protein  31.94 
 
 
313 aa  99  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1712  hypothetical protein  36.17 
 
 
323 aa  93.2  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81171  normal  0.0796717 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  28.35 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  29.38 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  30 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  34.78 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  32.34 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  27.53 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  28.85 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  35.53 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  27.42 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  32.5 
 
 
424 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  31.06 
 
 
294 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  35.71 
 
 
314 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.18 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  29.87 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  32.67 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  31.37 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.31 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  30.5 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  37.9 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0739  hypothetical protein  31.78 
 
 
382 aa  57  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.97 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  36.96 
 
 
317 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1498  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
372 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.219289  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  30.5 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  30.5 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  30.12 
 
 
298 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  30.5 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0392  hypothetical protein  30.51 
 
 
329 aa  55.8  0.0000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.280774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  35 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  30.68 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  29.73 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  31.29 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  32.88 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0822  hypothetical protein  41.54 
 
 
376 aa  54.3  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  32.32 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  32.09 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  33.11 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  29.88 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  29.79 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  30.67 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  32.86 
 
 
325 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.05 
 
 
286 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  27.1 
 
 
337 aa  52.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl482  putative lipase  29.85 
 
 
381 aa  50.8  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.41792  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  32.43 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  29.41 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  32.45 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0172  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.34441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  32.81 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  31.79 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  32.81 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  32.81 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  32.2 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  32.81 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  30.92 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  29.47 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  30.5 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  32.81 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  32.81 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  32.81 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  32.81 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  28.74 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  30.38 
 
 
490 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0588  putative alpha/beta superfamily hydrolase  32.64 
 
 
345 aa  50.4  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.123084  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  31.5 
 
 
284 aa  49.7  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25 
 
 
557 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  29.05 
 
 
307 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
295 aa  49.3  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.11 
 
 
255 aa  49.3  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  28.86 
 
 
313 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.67 
 
 
701 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  31.03 
 
 
286 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.73 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  34.34 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  28.66 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  28.97 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  31.03 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  26.17 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  28.19 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.57 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  32.8 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  27.21 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  32.85 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  27.21 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  27.21 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  28.68 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  28.68 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  28.68 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  28.68 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  28.68 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  29.1 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  29.08 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
374 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  26.47 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>