More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2852 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 297 aa  609  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 		 295 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 		 295 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  42.42 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  39.19 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  38.51 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  39.66 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  38.97 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  39.09 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  42.95 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  36.33 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  39.31 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  35.99 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  36.14 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  34.46 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  41.95 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  34.81 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  36.43 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  33.92 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  31.62 
 
 		 309 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  31.88 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  32.34 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  31.88 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  31.9 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  30.42 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  33.57 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  32.52 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  32.97 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  34.66 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  32.69 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  30.52 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  29.93 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  30.92 
 
 		 326 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  29.63 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  29.53 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  39.13 
 
 		 467 aa  82.8  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  27.23 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  28.15 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  26.79 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  26.39 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  28.01 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8503  putative lipoprotein  36.76 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  37.88 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  32.03 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001536  hydrolases of the alpha/beta superfamily  34.07 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  34.81 
 
 		 359 aa  65.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  31.75 
 
 		 868 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  24.29 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  41.58 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  30.17 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  27.5 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  39.52 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  27.95 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2753  hypothetical protein  33.5 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  30.15 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  27.33 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  33.58 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  27.33 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  25.95 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  34.29 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  29.17 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  27.33 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  27.33 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  27.33 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  27.33 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  37.78 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  31.65 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  27.33 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  31.74 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  23.57 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  32.31 
 
 		 866 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  27.54 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  28.89 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  30.46 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  27.86 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  30.94 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  30.94 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  31.2 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  37.78 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  36.26 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  36.26 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  36.26 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  36.26 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  35.9 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  33.93 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  29.33 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>