242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3976 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  100 
 
 
296 aa  594  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  78.55 
 
 
295 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  43.64 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  42.96 
 
 
295 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  46.79 
 
 
306 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  52.03 
 
 
312 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  46.42 
 
 
295 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  44.9 
 
 
306 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  45.19 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  43.88 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
297 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  41.67 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  40.75 
 
 
308 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  36.64 
 
 
316 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  41.97 
 
 
295 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  41.97 
 
 
295 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  40.15 
 
 
316 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  37.58 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  38.44 
 
 
314 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  38.76 
 
 
321 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  36.3 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  39.47 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  38.19 
 
 
313 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
313 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
313 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
313 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  35.91 
 
 
302 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 
321 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  35.56 
 
 
311 aa  139  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  34.53 
 
 
292 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  34.98 
 
 
298 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  33.57 
 
 
298 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  34.33 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  34.05 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  31.02 
 
 
309 aa  125  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  30.6 
 
 
298 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
304 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  30.07 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  31.46 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  34.92 
 
 
301 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  31.1 
 
 
300 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  31.92 
 
 
297 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  33.83 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  35.04 
 
 
451 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  28.7 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  37.39 
 
 
467 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  36.04 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  30.46 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  33.82 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  36.45 
 
 
1010 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  31.34 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  28.06 
 
 
345 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  29.55 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  28.79 
 
 
305 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  28.79 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  29.41 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  30.25 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  30.25 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  29.41 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  29.41 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  29.41 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  31.16 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  29.41 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  30.25 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  31.13 
 
 
868 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  31.01 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  30.69 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  29.75 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  32.79 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  30.43 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  31.75 
 
 
281 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  33.6 
 
 
866 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  31.03 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  30.82 
 
 
532 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  33.83 
 
 
254 aa  56.2  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  30.52 
 
 
309 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  25.52 
 
 
292 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  31.68 
 
 
237 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  32.79 
 
 
293 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  32.79 
 
 
284 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  32.79 
 
 
284 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  32.79 
 
 
284 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  32.79 
 
 
293 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  33.1 
 
 
256 aa  55.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  32.79 
 
 
284 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  28.26 
 
 
329 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  28.35 
 
 
368 aa  55.8  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  34.51 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  31.82 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  27.27 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  31.97 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  30.88 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  31.9 
 
 
346 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  25.32 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  36.11 
 
 
272 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  29.1 
 
 
342 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  33.03 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>