More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4244 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  27.15 
 
 
638 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.97 
 
 
688 aa  72.4  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1970  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.63 
 
 
652 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0646557  normal  0.172612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  28.64 
 
 
657 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.19 
 
 
607 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.69 
 
 
652 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.07 
 
 
638 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.24 
 
 
644 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  29.94 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.91 
 
 
626 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  26.01 
 
 
678 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.32 
 
 
607 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.63 
 
 
645 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.91 
 
 
626 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0375  prolyl oligopeptidase family protein  26.99 
 
 
612 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.91 
 
 
626 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2657  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29 
 
 
426 aa  65.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.96 
 
 
650 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.52 
 
 
653 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2781  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  27.89 
 
 
264 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.21 
 
 
665 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1344  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.27 
 
 
629 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.23 
 
 
607 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.43 
 
 
685 aa  63.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.5 
 
 
652 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.4 
 
 
641 aa  62.8  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.42 
 
 
632 aa  62.4  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41620  peptidase  28.12 
 
 
651 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  24.45 
 
 
655 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.45 
 
 
654 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  24.45 
 
 
654 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.35 
 
 
615 aa  62.4  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  24.02 
 
 
655 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  24.02 
 
 
655 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2300  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  26.05 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887585 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.35 
 
 
654 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.68 
 
 
642 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0240  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.88 
 
 
572 aa  60.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.393632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  24.1 
 
 
652 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  34.23 
 
 
402 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.8 
 
 
665 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  23 
 
 
339 aa  60.1  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.7 
 
 
656 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0773  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.37 
 
 
571 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.73 
 
 
617 aa  59.3  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.32 
 
 
667 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.46 
 
 
642 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.59 
 
 
668 aa  58.9  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.31 
 
 
706 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.77 
 
 
655 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.17 
 
 
622 aa  58.5  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2053  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.08 
 
 
644 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1686  prolyl oligopeptidase family protein  27.41 
 
 
678 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  29.18 
 
 
408 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  26.24 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.08 
 
 
644 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  29.83 
 
 
326 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  25.74 
 
 
384 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.23 
 
 
645 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  24.77 
 
 
654 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1648  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  27.27 
 
 
710 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158982  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 
682 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  26.54 
 
 
391 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.23 
 
 
645 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0739  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.52 
 
 
309 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.231286  hitchhiker  0.00721171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  32.64 
 
 
720 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38770  putative peptidase  31.94 
 
 
608 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.31 
 
 
733 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.58 
 
 
623 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4675  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.69 
 
 
608 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637214  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.57 
 
 
682 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.82 
 
 
645 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 
682 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 
682 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.46 
 
 
594 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1126  peptidase S15  26.67 
 
 
335 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  35.16 
 
 
424 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.35 
 
 
907 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  25.5 
 
 
467 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.41 
 
 
677 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.72 
 
 
645 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  47.17 
 
 
337 aa  55.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1301  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.84 
 
 
678 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.32869  normal  0.0583688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  33.1 
 
 
296 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  28.11 
 
 
645 aa  55.8  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  45.28 
 
 
342 aa  55.8  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0804  putative aminopeptidase protein  29.14 
 
 
306 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3304  putative peptidase  32.64 
 
 
608 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  25.11 
 
 
411 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0668  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.75 
 
 
719 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.37275  normal  0.141297 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  35 
 
 
333 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1156  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.58 
 
 
643 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5162  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.77 
 
 
574 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  33.33 
 
 
367 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.82 
 
 
676 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.999048  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  26.48 
 
 
642 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  31.39 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2589  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.67 
 
 
677 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2656  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.67 
 
 
677 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>