More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4246 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  100 
 
 
316 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  58.93 
 
 
314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  41.35 
 
 
326 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  51.7 
 
 
298 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  45.23 
 
 
322 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  47.78 
 
 
295 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  35.98 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  24.89 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  28.14 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  32.52 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.97 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.08 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  30.05 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.48 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  27.51 
 
 
294 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
305 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  27.32 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  24.18 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  23.71 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  27.43 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  29.79 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.33 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  24.55 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  25.44 
 
 
292 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0588  putative alpha/beta superfamily hydrolase  30 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.123084  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  25.44 
 
 
292 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  25.44 
 
 
292 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  23.61 
 
 
319 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  29.65 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.04 
 
 
360 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.9 
 
 
628 aa  59.3  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.6 
 
 
297 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.29 
 
 
259 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0392  hypothetical protein  23.21 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.280774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  26.64 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  25.98 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  23.28 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  27.66 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  23.11 
 
 
250 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  23.28 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  27.45 
 
 
277 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  26.39 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  29.53 
 
 
253 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  30.17 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2202  dienelactone hydrolase  30.6 
 
 
528 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.413126  decreased coverage  0.0031404 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  30.17 
 
 
286 aa  57  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.89 
 
 
314 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  25.79 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  30.98 
 
 
524 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  23.71 
 
 
319 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  26.7 
 
 
292 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.44 
 
 
621 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  32.68 
 
 
506 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  24.53 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  28.3 
 
 
306 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  24.48 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  26.21 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  27.65 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl482  putative lipase  24.43 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.41792  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.12 
 
 
612 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  34.51 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  22.44 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  26.21 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  34.15 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  26.34 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  27.18 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.72 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  31.98 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  33.52 
 
 
453 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  28.84 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  34.17 
 
 
292 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  27.91 
 
 
498 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  29.23 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  20.31 
 
 
287 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  29.59 
 
 
276 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  28.05 
 
 
467 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  34.4 
 
 
386 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  34.23 
 
 
363 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.48 
 
 
644 aa  52.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  23.16 
 
 
293 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  25.79 
 
 
301 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.86 
 
 
596 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  23.16 
 
 
293 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  22.92 
 
 
284 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  27.75 
 
 
307 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  32.28 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  29.65 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  29.17 
 
 
281 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  24.75 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  22.92 
 
 
284 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  23.44 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.44 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  23.16 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  23.86 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  28.9 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>