More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2823 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  100 
 
 
298 aa  590  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  50.84 
 
 
326 aa  271  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  56.67 
 
 
314 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  48.9 
 
 
295 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  43.94 
 
 
322 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  48.99 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 
305 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  33.04 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  30 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.97 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.23 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  28.76 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  29.49 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  27.24 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  30.48 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  28.87 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  27.47 
 
 
298 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  25.52 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  25.52 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  27.34 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  28.03 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  24.89 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  31.33 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.82 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  28.87 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  23.81 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.45 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  25.71 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  28.87 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  29.17 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  26.75 
 
 
648 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  28.03 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  24.26 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  28.89 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.28 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  25.75 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  28.21 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  27.17 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  32.02 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  26.26 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  29.18 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  34.16 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  23.63 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  30 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  31.4 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.2 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  35.94 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.76 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  25.69 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  24.73 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  26.58 
 
 
281 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  29.13 
 
 
256 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3436  esterase  27.32 
 
 
250 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  24.25 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  33.12 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  25.23 
 
 
265 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  25.44 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.47 
 
 
621 aa  62.4  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  25.28 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0804  putative aminopeptidase protein  24.73 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  28.37 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3593  esterase  27.42 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  22.11 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  26.05 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.31 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  25.32 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  29.52 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  30.3 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  24.74 
 
 
313 aa  60.8  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  27.31 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.91 
 
 
650 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  24.89 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  25.32 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  24.89 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  37.6 
 
 
298 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  24.29 
 
 
494 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  24.89 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  21.33 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  25.32 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  30.13 
 
 
287 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.56 
 
 
557 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.98 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  29.72 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl606  putative hydrolase  23.16 
 
 
340 aa  59.3  0.00000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  25 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  32.89 
 
 
424 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  30.62 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  29.58 
 
 
279 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  28.96 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  20.52 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  28.51 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.92 
 
 
644 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  34.13 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  28.69 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  32.8 
 
 
876 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  29.24 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>