248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3228 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  48.5 
 
 
345 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  48.2 
 
 
319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  47.92 
 
 
319 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  46.47 
 
 
319 aa  279  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  46.54 
 
 
319 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  47.47 
 
 
319 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  47 
 
 
300 aa  272  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  43.75 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  40.38 
 
 
314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  41.51 
 
 
309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  44.15 
 
 
337 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  43.48 
 
 
337 aa  248  8e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0108  hypothetical protein  41.01 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000248564  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  44.49 
 
 
313 aa  238  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  43.33 
 
 
283 aa  238  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  47.72 
 
 
307 aa  233  5e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  36.92 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0588  putative alpha/beta superfamily hydrolase  36.92 
 
 
345 aa  179  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.123084  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0215  hydrolase of the alpha/beta superfamily  35.63 
 
 
316 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000127658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  34.25 
 
 
306 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  28.71 
 
 
308 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  28.38 
 
 
307 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  28.38 
 
 
307 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  28.38 
 
 
307 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  28.38 
 
 
307 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  28.38 
 
 
307 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  28.05 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  30.36 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  29.54 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  30.36 
 
 
307 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  27.72 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  33.21 
 
 
313 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  32.82 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  33.88 
 
 
313 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  30.43 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  23.72 
 
 
306 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.96 
 
 
314 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  29.13 
 
 
292 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  26.64 
 
 
290 aa  102  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  31.03 
 
 
311 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  32.3 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  29.3 
 
 
294 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  26.79 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.96 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  25.68 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  26.19 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  28.57 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  26 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  24.92 
 
 
312 aa  86.7  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.91 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.1 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.7 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  26.98 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.9 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.12 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  25.88 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  27.02 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  26.19 
 
 
347 aa  77  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.04 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  27.49 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  27.54 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  27.54 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl390  hydrolase  28.95 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0649986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  23.16 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  27.13 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0739  hypothetical protein  28.22 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  27.06 
 
 
424 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  23.11 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0385  hypothetical protein  26.46 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  25.51 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  25.61 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl606  putative hydrolase  24.06 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  23.02 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0822  hypothetical protein  26.16 
 
 
376 aa  65.9  0.0000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  25.2 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0392  hypothetical protein  28.02 
 
 
329 aa  65.1  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.280774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  25.29 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl315  lysophospholipase  24.8 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.71518e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  22.9 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  24.55 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  25.1 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  25.1 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  25.1 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  25.1 
 
 
284 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  25.1 
 
 
284 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  25.53 
 
 
284 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  25.1 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  24.23 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  24.71 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  24.89 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.82 
 
 
271 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  25.66 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  25.93 
 
 
561 aa  59.3  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  22.85 
 
 
303 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.02 
 
 
631 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  24.9 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>