154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000946 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  100 
 
 
285 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  86.52 
 
 
284 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  58.21 
 
 
283 aa  358  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  28.47 
 
 
320 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  28.36 
 
 
320 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  28.97 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  28.17 
 
 
277 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  27.95 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  29.44 
 
 
294 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  29.76 
 
 
285 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  27.2 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  25.88 
 
 
292 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  25.88 
 
 
293 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  25.56 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  32.39 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  26.56 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  27.57 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  25.52 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  23.13 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  25.12 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  26.29 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  23.16 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  25.98 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  26.33 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  28 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  23.83 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  24.53 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  25.4 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  26.01 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  24.88 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  25.23 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  25.81 
 
 
296 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  23.7 
 
 
326 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  24.9 
 
 
288 aa  59.7  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  22.96 
 
 
277 aa  58.9  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  25.53 
 
 
363 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  21.68 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  25.25 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  24.14 
 
 
300 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  27.78 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
295 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  23.27 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  23.76 
 
 
319 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  26.67 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  23.76 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  36.28 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  25.7 
 
 
326 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 
275 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 
347 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  24.26 
 
 
319 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  23.67 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  30.81 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  22.28 
 
 
316 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.54 
 
 
261 aa  50.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  24.87 
 
 
306 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  33.33 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  33.75 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  32.11 
 
 
380 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  22.89 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  22.94 
 
 
256 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  27.54 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  20.97 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14054  predicted protein  23.03 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 
311 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  35.29 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  22.29 
 
 
314 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
315 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 
267 aa  46.6  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  30.26 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  29.63 
 
 
288 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 
322 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  28.87 
 
 
255 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
288 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl606  putative hydrolase  25.82 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  36.17 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  23.58 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.91 
 
 
370 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  24.17 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  29.03 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  39.76 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  24.12 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  32.04 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5281  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 
258 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  24.83 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  36.56 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  27.89 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.75 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>