More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0402 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
279 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  69.06 
 
 
291 aa  350  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  69.06 
 
 
291 aa  350  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  60.71 
 
 
294 aa  332  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  57.57 
 
 
328 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5281  alpha/beta hydrolase fold protein  59.7 
 
 
288 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  42.59 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  44.73 
 
 
302 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  41.85 
 
 
289 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  41.24 
 
 
286 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  41.85 
 
 
300 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  44.78 
 
 
313 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  36.33 
 
 
277 aa  148  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  35.97 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  37.35 
 
 
284 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  34.66 
 
 
254 aa  146  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  35.25 
 
 
277 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  40.21 
 
 
303 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  40.21 
 
 
303 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  41.28 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 
303 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  39.93 
 
 
303 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 
302 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  35.11 
 
 
277 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
253 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  37.63 
 
 
306 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 
302 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
279 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 
320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  37.1 
 
 
288 aa  129  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  33.97 
 
 
257 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  37.24 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  35.97 
 
 
279 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  35.97 
 
 
279 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  35.97 
 
 
279 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
245 aa  123  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
281 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 
276 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
277 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 
286 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  36.12 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  39.07 
 
 
320 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
275 aa  119  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 
330 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  33.98 
 
 
279 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 
306 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
263 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  28.42 
 
 
594 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 
303 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
268 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  30.36 
 
 
265 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
594 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  35.53 
 
 
278 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  28.16 
 
 
280 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  26.86 
 
 
585 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
278 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
589 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830773  normal  0.156007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  34.41 
 
 
278 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 
559 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0893  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
589 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1375  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
589 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0199502  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1660  lysophospholipase  32.14 
 
 
281 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.631285  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.31 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1278  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
599 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  28.69 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
599 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  29.21 
 
 
589 aa  95.5  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6100  predicted protein  30.43 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00681545  normal  0.399309 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1173  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
578 aa  95.5  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000196015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4012  Alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
591 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
324 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  25.71 
 
 
279 aa  92.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3081  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
587 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1290  hypothetical protein  23.08 
 
 
587 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.620525  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
290 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3003  hypothetical protein  23.08 
 
 
587 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  31.01 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  25.1 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  27.64 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  25.57 
 
 
267 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  25.57 
 
 
267 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  25.57 
 
 
277 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1728  Alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
578 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  25.19 
 
 
267 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>