68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02180 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  29.3 
 
 
287 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  26.55 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  24.58 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  29.36 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  27.98 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  25 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  30.05 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  25.23 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  22.37 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  25.15 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  21.43 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  23.24 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  23.18 
 
 
363 aa  63.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  24.34 
 
 
301 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  22.71 
 
 
277 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  23.23 
 
 
308 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  23.32 
 
 
320 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  23.32 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  21.36 
 
 
277 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  22.18 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  21.74 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  23.2 
 
 
285 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  26.15 
 
 
294 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  21.3 
 
 
292 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  23.13 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  21.3 
 
 
293 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
284 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  21.97 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  21.64 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  22.68 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  21.56 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  28.21 
 
 
277 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  23.48 
 
 
295 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  23.27 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  24.44 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  32.94 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  20.97 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
562 aa  45.8  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  29.41 
 
 
255 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  21.9 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  21.72 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  19.89 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25.13 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  29.13 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  24 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0243  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000221777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  23.01 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  22.67 
 
 
260 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  27.83 
 
 
257 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  19.31 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 
257 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1728  Alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
578 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 
257 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
263 aa  42.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
273 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  21.34 
 
 
288 aa  42.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>