133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3537 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  100 
 
 
287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  31.91 
 
 
302 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  30.55 
 
 
285 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  33.63 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  30.53 
 
 
308 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  32.16 
 
 
322 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 
311 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  32.23 
 
 
320 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  29.02 
 
 
288 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  27.27 
 
 
308 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  30.23 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  28.97 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  31.5 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  28.16 
 
 
294 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  28.77 
 
 
284 aa  95.9  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  28.22 
 
 
326 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  28.25 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  27.72 
 
 
283 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  32.37 
 
 
343 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  29.96 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  30.1 
 
 
301 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  28.57 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  29.68 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  25.17 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  26.37 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  29.23 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  29.06 
 
 
363 aa  79  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  27.43 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  23.3 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  29.54 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  25.91 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  25.91 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  27.73 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  25.78 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  26.62 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  27.86 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  22.37 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  33.86 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  27.17 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  24.91 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  25.56 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  27.55 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  23.74 
 
 
267 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
360 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  23.53 
 
 
346 aa  53.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  23.93 
 
 
312 aa  52.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  20.69 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  24.63 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02220  hypothetical protein  26.35 
 
 
151 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  31.82 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04030  hypothetical protein  25.64 
 
 
339 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  30.73 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  24.86 
 
 
313 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0160  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 
288 aa  48.9  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  26.2 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  25.48 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 
338 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5299  hypothetical protein  26.26 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  24.02 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  22.51 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  24.31 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  22.07 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  25.66 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  24.39 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  33.02 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  36.62 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  30.91 
 
 
294 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  28.28 
 
 
282 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  28.28 
 
 
282 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  30.91 
 
 
294 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  25.28 
 
 
277 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  23.15 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
254 aa  47  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 
276 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1660  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
278 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  25.08 
 
 
395 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  27.05 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 
400 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  24.25 
 
 
273 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  25.19 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  27.19 
 
 
253 aa  46.2  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  24.34 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  30.56 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  24.25 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  20.6 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0766  protein of unknown function UPF0227  25.9 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0766  protein of unknown function UPF0227  26.51 
 
 
213 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>