274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0273 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  28.4 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  33.8 
 
 		 343 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  29.7 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  33.18 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  32.89 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  31.1 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  25.47 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  31.5 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  30.29 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  26.46 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  31.13 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  31.13 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  30.92 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  30.77 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  25.78 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  26.57 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  23.26 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  25.94 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  24.53 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  28.7 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  25 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  23.85 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  30.14 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  28.11 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  25.12 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  31.82 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  28.83 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  29.39 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  25 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  30.67 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  30.93 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  28.44 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.69 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  41.46 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  33.19 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  40.82 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  29.25 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  26.06 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  21.74 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  43.37 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.09 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  40.48 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  20.17 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  40.96 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  46.15 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2293  hypothetical protein  39.13 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.661266  normal  0.0651715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  40.96 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 		 324 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  37.35 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  34.83 
 
 		 236 aa  48.9  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 		 324 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  36.7 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  38.67 
 
 		 546 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  40.24 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  31.48 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  37.08 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1498  alpha/beta hydrolase fold  41.43 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.219289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  30.14 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  35.24 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>