58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1491 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  479  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2293  hypothetical protein  46.63 
 
 
222 aa  195  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.661266  normal  0.0651715 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1329  hypothetical protein  36.87 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1554  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
359 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  34.83 
 
 
277 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 
295 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3405  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
357 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  31.78 
 
 
318 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  25.37 
 
 
274 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  31.62 
 
 
276 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  28.7 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  24.63 
 
 
400 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  28.45 
 
 
285 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.59 
 
 
296 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.95 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
288 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 
280 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06630  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.51 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13780  alpha/beta hydrolase family protein  29.03 
 
 
451 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  25.64 
 
 
279 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  32.04 
 
 
491 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
277 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  25 
 
 
453 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.74 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  28.57 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1212  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
344 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  33.33 
 
 
493 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  28.82 
 
 
318 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.77 
 
 
280 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  26.09 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2136  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137124  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  30.41 
 
 
295 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 
276 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  31.73 
 
 
303 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  31.73 
 
 
303 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  31.73 
 
 
303 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  24.74 
 
 
317 aa  42.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1336  putative carboxylesterase  33.66 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  31.73 
 
 
303 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  31.73 
 
 
303 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  28.3 
 
 
258 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  31.73 
 
 
280 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  31.73 
 
 
280 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
264 aa  42.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  30.43 
 
 
512 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  30.97 
 
 
506 aa  42  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  29.29 
 
 
276 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 
270 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  26.8 
 
 
256 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  27.59 
 
 
270 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  28.3 
 
 
258 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  27.41 
 
 
328 aa  42  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0864  hydrolase  29.31 
 
 
314 aa  41.6  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.020243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  27.97 
 
 
593 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>