99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2291 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  68 
 
 		 256 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  66 
 
 		 270 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  66.4 
 
 		 256 aa  360  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  65.6 
 
 		 256 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  67.07 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  63.97 
 
 		 248 aa  333  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  64.26 
 
 		 258 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  63.86 
 
 		 258 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  54.66 
 
 		 276 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  55.79 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  56.54 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  54.96 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  57.26 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6153  hypothetical protein  54.22 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  55.47 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  55.47 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  52.77 
 
 		 242 aa  262  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  26.11 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  30.34 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  32.71 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  27.46 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.39 
 
 		 680 aa  52.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  32.59 
 
 		 1010 aa  52  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  21.09 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  27.37 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.95 
 
 		 686 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  29.46 
 
 		 876 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.97 
 
 		 692 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  29.29 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  29.29 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 572 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  35.29 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  30.3 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2293  hypothetical protein  30.63 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.661266  normal  0.0651715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  33.33 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.84 
 
 		 634 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.41 
 
 		 691 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  30.37 
 
 		 453 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  22.82 
 
 		 735 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  28.99 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.99 
 
 		 688 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.99 
 
 		 692 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  23.56 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.93 
 
 		 652 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  30.83 
 
 		 638 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  26.71 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  32.32 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  33.61 
 
 		 474 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.26 
 
 		 677 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  31 
 
 		 968 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  29.32 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  29.81 
 
 		 572 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  29.81 
 
 		 572 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  29.81 
 
 		 567 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  26.23 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  32.23 
 
 		 868 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.93 
 
 		 668 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  30.83 
 
 		 897 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  28.41 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  29.91 
 
 		 866 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  26.79 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.7 
 
 		 668 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  35.58 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.82 
 
 		 653 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  26.72 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  31.45 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3439  hypothetical protein  33.71 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  30.72 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  31.71 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  29.31 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1326  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  31.71 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  32.04 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  28.93 
 
 		 678 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  29.51 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 976 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  27.32 
 
 		 315 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  28.74 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  26.8 
 
 		 282 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  21.15 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.97 
 
 		 751 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  27.64 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  28.46 
 
 		 337 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  28.79 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  30.23 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  20.72 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  29.73 
 
 		 365 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  30.17 
 
 		 467 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.64 
 
 		 721 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.41 
 
 		 634 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  30.84 
 
 		 618 aa  42.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  20.61 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1899  lysophospholipase-like protein  25.64 
 
 		 340 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  31.37 
 
 		 498 aa  42  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  20.5 
 
 		 261 aa  42  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>