119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0074 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  73.36 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  62.24 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6153  hypothetical protein  61.22 
 
 		 271 aa  310  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  59.34 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  61.51 
 
 		 260 aa  293  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  57.44 
 
 		 270 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  57.44 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  57.02 
 
 		 256 aa  288  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  56.61 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  55.79 
 
 		 256 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  55.79 
 
 		 256 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  57.26 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  56.49 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  55.65 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  55.23 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  55.23 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  51.44 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.77 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  38.18 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.8 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.97 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  31.67 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  25.1 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  27.98 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  20.31 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.58 
 
 		 653 aa  52.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  34.95 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  23.01 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  23.81 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  23.69 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.65 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  36.61 
 
 		 307 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  28.08 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.2 
 
 		 557 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  29.27 
 
 		 678 aa  48.5  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  29.31 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  31.75 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.59 
 
 		 319 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  29.17 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.64 
 
 		 652 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  27.31 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  24.87 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  22.17 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.61 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  28.7 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  30.43 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  28.05 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  23.71 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  24.54 
 
 		 269 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  29.21 
 
 		 292 aa  45.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  24.61 
 
 		 281 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.39 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.15 
 
 		 297 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  24.24 
 
 		 310 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  30.98 
 
 		 282 aa  45.4  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  25.37 
 
 		 263 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  26.57 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  33.68 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  34.95 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  35.06 
 
 		 653 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.72 
 
 		 357 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  29.23 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  24.87 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.06 
 
 		 651 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  31.33 
 
 		 363 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  23.79 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  28.67 
 
 		 420 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  25.6 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  32.63 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.66 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  27.64 
 
 		 657 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2193  hypothetical protein  35.82 
 
 		 674 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  31.3 
 
 		 299 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  21.95 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  21.88 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  23.79 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.06 
 
 		 653 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  30.69 
 
 		 968 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  24.89 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  30.53 
 
 		 1010 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  31.25 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  28.28 
 
 		 868 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  28.67 
 
 		 385 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  19.5 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  22.94 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  29.48 
 
 		 385 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  30.7 
 
 		 580 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.66 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  26.74 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  22.73 
 
 		 721 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  24.4 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  26.22 
 
 		 406 aa  42.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  25.35 
 
 		 301 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>