120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5068 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  63.11 
 
 		 260 aa  332  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  59.84 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  59.84 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  58.63 
 
 		 248 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  58.43 
 
 		 259 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  55.92 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  55.51 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  55.51 
 
 		 270 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  54.66 
 
 		 256 aa  285  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  55.92 
 
 		 256 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  57.26 
 
 		 244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  52.57 
 
 		 252 aa  278  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6153  hypothetical protein  55.02 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  51.84 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  52.24 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  56.85 
 
 		 267 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  53.71 
 
 		 242 aa  254  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.2 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  22.18 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.12 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  22.75 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.71 
 
 		 695 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.43 
 
 		 735 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  33.64 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  23.01 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  34.53 
 
 		 451 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  29.32 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.6 
 
 		 653 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.79 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  28.5 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  24.37 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  28.23 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.07 
 
 		 557 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  29.63 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  28.77 
 
 		 304 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  23.64 
 
 		 638 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  30.53 
 
 		 868 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0508  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  26.02 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  26.92 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  32.04 
 
 		 876 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.49 
 
 		 701 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.71 
 
 		 654 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.09 
 
 		 654 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  23.5 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  26.09 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  31.62 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  33.33 
 
 		 1010 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2293  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.661266  normal  0.0651715 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  34.17 
 
 		 356 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.77 
 
 		 615 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  31.54 
 
 		 968 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  26.41 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.17 
 
 		 572 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  28.18 
 
 		 292 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.6 
 
 		 651 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  29.79 
 
 		 238 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.71 
 
 		 388 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  22.22 
 
 		 281 aa  46.2  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  31.73 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.77 
 
 		 653 aa  45.8  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  29.73 
 
 		 298 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.83 
 
 		 662 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  29.21 
 
 		 453 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.35 
 
 		 662 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0192  hypothetical protein  26.26 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  30.43 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  31.19 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  23.4 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  23.2 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  31.78 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  27.59 
 
 		 497 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.11 
 
 		 634 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  35.11 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_002950  PG1361  dipeptidyl aminopeptidase IV, putative  22.61 
 
 		 732 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.66 
 
 		 622 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.98 
 
 		 594 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.43 
 
 		 659 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.55 
 
 		 660 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.55 
 
 		 662 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  33.61 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.55 
 
 		 662 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.62 
 
 		 653 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  31.91 
 
 		 866 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.96 
 
 		 661 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  31.43 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  34.21 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  35.71 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  26.67 
 
 		 408 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  32.19 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.36 
 
 		 677 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  30.97 
 
 		 501 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  30.51 
 
 		 897 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  31.01 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  30 
 
 		 405 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.34 
 
 		 630 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>