139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4797 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  618  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  29.75 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  29.01 
 
 		 349 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  28.63 
 
 		 349 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  30.5 
 
 		 326 aa  85.9  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  30.2 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  28.29 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  30.48 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  30.93 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  27.84 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  34.33 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  27.07 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  31.17 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  26.04 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  27.76 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  27.98 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  27.18 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  32.11 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  26.23 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  35.24 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  29.38 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  24.23 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  33.04 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  29.05 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  32.81 
 
 		 342 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  25.6 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  28.99 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  35.14 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  31.78 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  31.78 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  27.42 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  26.58 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  31.78 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  31.25 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  32.14 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  29.03 
 
 		 342 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  36.04 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  32.9 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.71 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.14 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  32.03 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  32.04 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  31.3 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  31.28 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  28.82 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  29.87 
 
 		 356 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  31.78 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  29.87 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  25.53 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  33.03 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  29.87 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  32.14 
 
 		 355 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  33.33 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  29.79 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  29.81 
 
 		 368 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  31.4 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  32.38 
 
 		 368 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  25.74 
 
 		 320 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  31.78 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  25.69 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  31.58 
 
 		 354 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  28.85 
 
 		 333 aa  48.9  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  24.06 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  31.43 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  22.79 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  32 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  27.93 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  33.06 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  33.02 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  29.69 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  35.79 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  27.05 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2341  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  31.4 
 
 		 438 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  30.91 
 
 		 132 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  34.74 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  27.73 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  26.47 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0614  dipeptidyl peptidase IV, putative  22.65 
 
 		 826 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  26.27 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  23.91 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  26.92 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  30.48 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.64 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  23.91 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  26.15 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  24.81 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  26.15 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  26.15 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  30.51 
 
 		 355 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  28.71 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  29.81 
 
 		 367 aa  45.8  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  25.81 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  29.81 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  29.31 
 
 		 690 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  28 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  25.83 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  30.97 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>