111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0986 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  37.82 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0498  hypothetical protein  30.97 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  29.71 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0541  hypothetical protein  29.41 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  0.956767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  34.62 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  32.19 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  33.03 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.77 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  34.29 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  27.98 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  29.07 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  28.93 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  33.64 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  30.71 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  35.29 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  31.73 
 
 		 647 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.46 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  26.5 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  33.04 
 
 		 271 aa  52  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  36.78 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  26.5 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  33.04 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  28.5 
 
 		 276 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  28.12 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  32.46 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  35.85 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  24.23 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  38.46 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  35.48 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  28.06 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  26.03 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  26.73 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  24.31 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  33.64 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  26.05 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  26.73 
 
 		 260 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  25.87 
 
 		 278 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  25.37 
 
 		 260 aa  48.5  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  24.74 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0532  hypothetical protein  35.71 
 
 		 146 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  26.98 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  26.98 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  30.64 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  24.31 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 331 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  38.46 
 
 		 272 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  34.78 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  29.17 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  42.19 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  41.27 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.88 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  42.31 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  25.64 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1452  hydrolase, alpha/beta fold family  27.18 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000259756 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  24.63 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  45.28 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  33.33 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  27.7 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3846  hydrolase, alpha/beta fold family  27.18 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  27.7 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 		 300 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19031  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.68 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  27.16 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  23.76 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  25.95 
 
 		 297 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.09 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  34.78 
 
 		 405 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  29.59 
 
 		 397 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  40.68 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  32.11 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  23.96 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3504  alpha/beta fold family hydrolase  26.61 
 
 		 271 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0369292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4685  hypothetical protein  34.62 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0057537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 295 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3592  alpha/beta fold family hydrolase  26.61 
 
 		 271 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.620275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3877  alpha/beta fold family hydrolase  26.61 
 
 		 271 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 274 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3492  alpha/beta fold family hydrolase  26.61 
 
 		 271 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000132504  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 267 aa  42.4  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3759  hydrolase, alpha/beta fold family  26.61 
 
 		 271 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000154361 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  36.23 
 
 		 145 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  46 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 300 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>