9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0541 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0541  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  0.956767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0498  hypothetical protein  86.12 
 
 		 291 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0532  hypothetical protein  82.19 
 
 		 146 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  29.41 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  25.69 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  31.5 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  25.61 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  31.25 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  31.2 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>