123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4531 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  100 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  89.89 
 
 
274 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  68.75 
 
 
269 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  63.71 
 
 
272 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  61.42 
 
 
647 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  62.03 
 
 
263 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  62.6 
 
 
259 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  61.98 
 
 
257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  55.6 
 
 
265 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  54.32 
 
 
259 aa  271  9e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  53.44 
 
 
255 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  55.56 
 
 
261 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  55.25 
 
 
257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  55.86 
 
 
257 aa  248  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  54.09 
 
 
261 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  56.03 
 
 
264 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  51.15 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  54.12 
 
 
252 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  54.12 
 
 
265 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  51.2 
 
 
271 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  51.2 
 
 
283 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  49.06 
 
 
272 aa  218  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  52.65 
 
 
258 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  51.97 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  46.96 
 
 
290 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  44.57 
 
 
249 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  48.88 
 
 
252 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  42.46 
 
 
264 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  41.57 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  41.92 
 
 
248 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  41.31 
 
 
247 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  40.68 
 
 
248 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  43.36 
 
 
254 aa  166  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  40 
 
 
251 aa  165  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  43.67 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  34.34 
 
 
279 aa  159  5e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  43.15 
 
 
244 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  33.04 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  39.91 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 
260 aa  135  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  33.47 
 
 
257 aa  129  8.000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  32 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  32 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  27.49 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  25.96 
 
 
258 aa  56.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  33.64 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.23 
 
 
367 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.62 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.79 
 
 
368 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.29 
 
 
368 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  26.77 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  28.28 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.79 
 
 
368 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.27 
 
 
372 aa  52.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  29.13 
 
 
237 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.54 
 
 
370 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  27.54 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  0.0000000954344 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.1 
 
 
254 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.02 
 
 
372 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  35.05 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0090  carboxylesterase, putative  25.83 
 
 
242 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 
297 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0135  protein of unknown function UPF0227  27.05 
 
 
216 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.91 
 
 
369 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0776  protein of unknown function UPF0227  30.1 
 
 
213 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  27.36 
 
 
294 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 
307 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.46 
 
 
370 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  27.27 
 
 
276 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  24.54 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  26.16 
 
 
268 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  39.08 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  26.43 
 
 
252 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0479  hypothetical protein  25.5 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000116996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0492  hypothetical protein  25.5 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000195032  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  33.33 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2219  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.05 
 
 
626 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.194335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  34.18 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
321 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
321 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
321 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.81 
 
 
370 aa  45.4  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.23 
 
 
370 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0498  hypothetical protein  26.58 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0547  putative carboxylesterase  27.75 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312098 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  27.89 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  32 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.15 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  24.33 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  28.88 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  25 
 
 
423 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
364 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28215  predicted protein  23.53 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>