55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0670 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  67.32 
 
 
647 aa  358  6e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  67.58 
 
 
259 aa  357  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  67.32 
 
 
263 aa  350  8.999999999999999e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  60.92 
 
 
274 aa  314  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  61.98 
 
 
277 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  56.77 
 
 
272 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  63.91 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  54.03 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  56.35 
 
 
265 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  58.01 
 
 
261 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  57.5 
 
 
261 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  57.56 
 
 
257 aa  255  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  57.33 
 
 
257 aa  251  7e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  54.85 
 
 
258 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  54.32 
 
 
265 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  51.69 
 
 
255 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  56.78 
 
 
264 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  53.16 
 
 
271 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  51.42 
 
 
283 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  50.63 
 
 
252 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  52.7 
 
 
272 aa  228  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  52.32 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  52.61 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  47.16 
 
 
290 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  41.39 
 
 
256 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  43.67 
 
 
249 aa  194  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  43.85 
 
 
254 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  44.73 
 
 
264 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  43.85 
 
 
248 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  46.34 
 
 
252 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  43.9 
 
 
247 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  41.3 
 
 
248 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  38.1 
 
 
251 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  41.5 
 
 
249 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  43.15 
 
 
248 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  43.57 
 
 
244 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 
254 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  33.91 
 
 
253 aa  154  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  36.8 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  33.47 
 
 
257 aa  146  3e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  31.13 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  31.13 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  27.97 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  23.68 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  32.46 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  23.46 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.74 
 
 
370 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.4 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.85 
 
 
368 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.15 
 
 
370 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.85 
 
 
368 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
322 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  28.64 
 
 
274 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>