81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3160 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  61.18 
 
 
252 aa  299  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  63.64 
 
 
283 aa  293  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  62.81 
 
 
271 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  58.1 
 
 
265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  61.29 
 
 
252 aa  284  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  57.75 
 
 
257 aa  276  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  56.97 
 
 
261 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  55.64 
 
 
261 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  59.3 
 
 
257 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  53.44 
 
 
277 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  60 
 
 
264 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  64.63 
 
 
265 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  54.23 
 
 
265 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  52.31 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  50.99 
 
 
272 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  50.78 
 
 
259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  50.78 
 
 
263 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  50.39 
 
 
647 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  53.82 
 
 
269 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  51.69 
 
 
257 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  53.33 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  53.94 
 
 
290 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  50.59 
 
 
272 aa  228  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  47.35 
 
 
259 aa  218  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
264 aa  212  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  47.81 
 
 
254 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  47.41 
 
 
248 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  48.74 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  46.06 
 
 
249 aa  188  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  42.97 
 
 
251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  49.56 
 
 
252 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  40.49 
 
 
256 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  44.92 
 
 
244 aa  168  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  43.57 
 
 
249 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  38.8 
 
 
247 aa  164  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 
253 aa  154  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  34.3 
 
 
257 aa  149  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  32.92 
 
 
260 aa  145  5e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 
254 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  38.1 
 
 
248 aa  138  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  31.08 
 
 
279 aa  125  5e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  36.02 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  36.02 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  31.22 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.42 
 
 
254 aa  59.3  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.56 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  36.78 
 
 
218 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.75 
 
 
257 aa  52  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  29.9 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  38.27 
 
 
260 aa  48.9  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  37.23 
 
 
274 aa  48.9  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.19 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  28.11 
 
 
397 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  26.56 
 
 
287 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.09 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  26.97 
 
 
287 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  27.59 
 
 
237 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 
329 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  27.08 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  23.95 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.53 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  26.14 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  26.14 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  26.14 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  25.42 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  24.17 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  42.17 
 
 
302 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
421 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  25.84 
 
 
285 aa  42  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>