167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2193 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  54.94 
 
 
249 aa  221  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  51.49 
 
 
251 aa  218  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  50.6 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  49.6 
 
 
290 aa  211  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  51.57 
 
 
257 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  49.37 
 
 
256 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  52.65 
 
 
248 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  49.39 
 
 
261 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  52.19 
 
 
257 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  47.92 
 
 
247 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  48.03 
 
 
265 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  47.92 
 
 
261 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  47.9 
 
 
259 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  46.34 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  49.36 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  48.88 
 
 
277 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  46.47 
 
 
258 aa  195  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  49.56 
 
 
255 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  46.86 
 
 
269 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  48.94 
 
 
283 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  47.73 
 
 
274 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  47.48 
 
 
263 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  48.12 
 
 
248 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  50.88 
 
 
264 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  49.58 
 
 
252 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  47.11 
 
 
265 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  47.06 
 
 
647 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  44.8 
 
 
272 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  50.22 
 
 
272 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  43.15 
 
 
259 aa  185  7e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  47.88 
 
 
252 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  45.27 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
265 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  47.44 
 
 
244 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  45.45 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  47.3 
 
 
254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  35.83 
 
 
253 aa  170  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  34.51 
 
 
260 aa  159  6e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  38.6 
 
 
279 aa  156  3e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  32.31 
 
 
257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  31.58 
 
 
276 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  31.58 
 
 
276 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.45 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  28.37 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  21.97 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.83 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.85 
 
 
371 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.85 
 
 
371 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.13 
 
 
376 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  37.7 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.85 
 
 
371 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.38 
 
 
371 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  31.13 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  28.89 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  35.25 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  24.77 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  35.25 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  35.25 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  36.22 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  33.86 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  36.54 
 
 
215 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
373 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  37.72 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  34.55 
 
 
223 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  36.54 
 
 
215 aa  48.9  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  36.54 
 
 
215 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  32.74 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  35.34 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  32.17 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2494  alpha/beta hydrolase fold protein  28.45 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120593  normal  0.158717 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  32.74 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  32.74 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  34.48 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  35.58 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  27.4 
 
 
410 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  35.58 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  32.17 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.16 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  33.65 
 
 
224 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  30.77 
 
 
225 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  21.55 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  31.19 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  32.11 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.85 
 
 
370 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  39.08 
 
 
300 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  31.19 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0416  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  19.64 
 
 
500 aa  45.8  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  30.43 
 
 
225 aa  46.2  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.65 
 
 
390 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  28.41 
 
 
260 aa  45.8  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.58 
 
 
268 aa  45.8  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  38.46 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  38.37 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4392  putative dioxygenase  28.3 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.537049  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 
362 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>